Protein–RNA interactions for Protein: P55041

Gem, GTP-binding protein GEM, mousemouse

Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GemP55041 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GemP55041 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GemP55041 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
GemP55041 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
GemP55041 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
GemP55041 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
GemP55041 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
GemP55041 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
GemP55041 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
GemP55041 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
GemP55041 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GemP55041 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GemP55041 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GemP55041 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GemP55041 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GemP55041 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GemP55041 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GemP55041 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GemP55041 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GemP55041 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GemP55041 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GemP55041 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GemP55041 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GemP55041 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GemP55041 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GemP55041 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GemP55041 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GemP55041 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GemP55041 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
GemP55041 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GemP55041 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GemP55041 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GemP55041 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GemP55041 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GemP55041 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GemP55041 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GemP55041 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GemP55041 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GemP55041 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GemP55041 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
GemP55041 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GemP55041 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GemP55041 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GemP55041 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GemP55041 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GemP55041 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GemP55041 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GemP55041 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GemP55041 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GemP55041 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GemP55041 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GemP55041 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GemP55041 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GemP55041 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GemP55041 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GemP55041 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GemP55041 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GemP55041 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GemP55041 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GemP55041 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GemP55041 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GemP55041 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
GemP55041 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GemP55041 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GemP55041 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GemP55041 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
GemP55041 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GemP55041 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GemP55041 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GemP55041 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
GemP55041 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GemP55041 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
GemP55041 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
GemP55041 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
GemP55041 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GemP55041 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GemP55041 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GemP55041 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GemP55041 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GemP55041 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GemP55041 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GemP55041 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GemP55041 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GemP55041 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GemP55041 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GemP55041 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GemP55041 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GemP55041 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GemP55041 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GemP55041 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
GemP55041 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GemP55041 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GemP55041 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GemP55041 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GemP55041 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GemP55041 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GemP55041 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GemP55041 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GemP55041 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GemP55041 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.9 ms