Protein–RNA interactions for Protein: P54846

Nrl, Neural retina-specific leucine zipper protein, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NrlP54846 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NrlP54846 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NrlP54846 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NrlP54846 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NrlP54846 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NrlP54846 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NrlP54846 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NrlP54846 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NrlP54846 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NrlP54846 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NrlP54846 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NrlP54846 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NrlP54846 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NrlP54846 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NrlP54846 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NrlP54846 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NrlP54846 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NrlP54846 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NrlP54846 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NrlP54846 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NrlP54846 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NrlP54846 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NrlP54846 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NrlP54846 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NrlP54846 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NrlP54846 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
NrlP54846 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
NrlP54846 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NrlP54846 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
NrlP54846 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NrlP54846 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NrlP54846 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NrlP54846 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NrlP54846 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NrlP54846 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NrlP54846 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
NrlP54846 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NrlP54846 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NrlP54846 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
NrlP54846 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NrlP54846 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NrlP54846 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NrlP54846 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NrlP54846 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NrlP54846 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NrlP54846 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NrlP54846 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NrlP54846 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NrlP54846 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NrlP54846 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NrlP54846 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NrlP54846 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NrlP54846 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NrlP54846 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NrlP54846 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NrlP54846 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NrlP54846 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NrlP54846 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NrlP54846 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NrlP54846 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NrlP54846 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NrlP54846 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NrlP54846 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NrlP54846 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NrlP54846 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NrlP54846 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NrlP54846 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NrlP54846 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NrlP54846 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NrlP54846 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NrlP54846 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NrlP54846 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NrlP54846 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NrlP54846 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC16■□□□□ 0.15
NrlP54846 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NrlP54846 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NrlP54846 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NrlP54846 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NrlP54846 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NrlP54846 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
NrlP54846 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NrlP54846 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NrlP54846 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NrlP54846 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NrlP54846 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
NrlP54846 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NrlP54846 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NrlP54846 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NrlP54846 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NrlP54846 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NrlP54846 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NrlP54846 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NrlP54846 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NrlP54846 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NrlP54846 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NrlP54846 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NrlP54846 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NrlP54846 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NrlP54846 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NrlP54846 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms