Protein–RNA interactions for Protein: P53349

Map3k1, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Map3k1P53349 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Map3k1P53349 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Map3k1P53349 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Map3k1P53349 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Map3k1P53349 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Map3k1P53349 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Map3k1P53349 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Map3k1P53349 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Map3k1P53349 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Map3k1P53349 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Map3k1P53349 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Map3k1P53349 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Map3k1P53349 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Map3k1P53349 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Map3k1P53349 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Map3k1P53349 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Map3k1P53349 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Map3k1P53349 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Map3k1P53349 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Map3k1P53349 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Map3k1P53349 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Map3k1P53349 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Map3k1P53349 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Map3k1P53349 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Map3k1P53349 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Map3k1P53349 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Map3k1P53349 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Map3k1P53349 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Map3k1P53349 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Map3k1P53349 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Map3k1P53349 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Map3k1P53349 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Map3k1P53349 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Map3k1P53349 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Map3k1P53349 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Map3k1P53349 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Map3k1P53349 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Map3k1P53349 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Map3k1P53349 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Map3k1P53349 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Map3k1P53349 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Map3k1P53349 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Map3k1P53349 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Map3k1P53349 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Map3k1P53349 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Map3k1P53349 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Map3k1P53349 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Map3k1P53349 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Map3k1P53349 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Map3k1P53349 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Map3k1P53349 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Map3k1P53349 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Map3k1P53349 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Map3k1P53349 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Map3k1P53349 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Map3k1P53349 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Map3k1P53349 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Map3k1P53349 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Map3k1P53349 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Map3k1P53349 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Map3k1P53349 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Map3k1P53349 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Map3k1P53349 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Map3k1P53349 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Map3k1P53349 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Map3k1P53349 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Map3k1P53349 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Map3k1P53349 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Map3k1P53349 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Map3k1P53349 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Map3k1P53349 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Map3k1P53349 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Map3k1P53349 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Map3k1P53349 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Map3k1P53349 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Map3k1P53349 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Map3k1P53349 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Map3k1P53349 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Map3k1P53349 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Map3k1P53349 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Map3k1P53349 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Map3k1P53349 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Map3k1P53349 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Map3k1P53349 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Map3k1P53349 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Map3k1P53349 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Map3k1P53349 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Map3k1P53349 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Map3k1P53349 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Map3k1P53349 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Map3k1P53349 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Map3k1P53349 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Map3k1P53349 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Map3k1P53349 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Map3k1P53349 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Map3k1P53349 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Map3k1P53349 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Map3k1P53349 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Map3k1P53349 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Map3k1P53349 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms