Protein–RNA interactions for Protein: P52479

Usp10, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 10, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 792 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp10P52479 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp10P52479 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp10P52479 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp10P52479 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp10P52479 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp10P52479 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp10P52479 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp10P52479 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp10P52479 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp10P52479 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp10P52479 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp10P52479 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp10P52479 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp10P52479 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp10P52479 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp10P52479 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp10P52479 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp10P52479 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp10P52479 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp10P52479 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp10P52479 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp10P52479 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp10P52479 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp10P52479 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp10P52479 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp10P52479 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp10P52479 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp10P52479 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp10P52479 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp10P52479 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp10P52479 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp10P52479 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp10P52479 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp10P52479 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp10P52479 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp10P52479 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp10P52479 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp10P52479 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp10P52479 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp10P52479 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp10P52479 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp10P52479 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp10P52479 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp10P52479 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp10P52479 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp10P52479 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp10P52479 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp10P52479 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp10P52479 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp10P52479 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp10P52479 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp10P52479 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp10P52479 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp10P52479 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp10P52479 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp10P52479 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp10P52479 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp10P52479 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp10P52479 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp10P52479 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp10P52479 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp10P52479 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp10P52479 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp10P52479 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp10P52479 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp10P52479 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp10P52479 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp10P52479 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp10P52479 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp10P52479 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp10P52479 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp10P52479 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp10P52479 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp10P52479 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp10P52479 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp10P52479 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp10P52479 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp10P52479 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp10P52479 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp10P52479 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp10P52479 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp10P52479 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp10P52479 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp10P52479 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp10P52479 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp10P52479 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp10P52479 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp10P52479 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp10P52479 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp10P52479 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp10P52479 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp10P52479 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp10P52479 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp10P52479 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp10P52479 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp10P52479 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp10P52479 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp10P52479 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp10P52479 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp10P52479 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms