Protein–RNA interactions for Protein: P50481

Lhx3, LIM/homeobox protein Lhx3, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhx3P50481 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lhx3P50481 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lhx3P50481 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lhx3P50481 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lhx3P50481 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lhx3P50481 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lhx3P50481 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lhx3P50481 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Lhx3P50481 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lhx3P50481 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lhx3P50481 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lhx3P50481 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lhx3P50481 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lhx3P50481 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lhx3P50481 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lhx3P50481 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lhx3P50481 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lhx3P50481 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lhx3P50481 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lhx3P50481 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lhx3P50481 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lhx3P50481 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lhx3P50481 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Lhx3P50481 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lhx3P50481 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Lhx3P50481 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lhx3P50481 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lhx3P50481 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lhx3P50481 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lhx3P50481 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lhx3P50481 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lhx3P50481 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lhx3P50481 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lhx3P50481 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lhx3P50481 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lhx3P50481 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lhx3P50481 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lhx3P50481 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lhx3P50481 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lhx3P50481 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lhx3P50481 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lhx3P50481 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lhx3P50481 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lhx3P50481 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lhx3P50481 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lhx3P50481 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lhx3P50481 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lhx3P50481 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lhx3P50481 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lhx3P50481 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Lhx3P50481 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lhx3P50481 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lhx3P50481 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Lhx3P50481 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lhx3P50481 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Lhx3P50481 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lhx3P50481 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lhx3P50481 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lhx3P50481 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lhx3P50481 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lhx3P50481 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lhx3P50481 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lhx3P50481 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Lhx3P50481 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Lhx3P50481 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Lhx3P50481 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Lhx3P50481 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Lhx3P50481 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lhx3P50481 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lhx3P50481 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lhx3P50481 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lhx3P50481 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lhx3P50481 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lhx3P50481 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lhx3P50481 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lhx3P50481 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lhx3P50481 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Lhx3P50481 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lhx3P50481 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lhx3P50481 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lhx3P50481 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lhx3P50481 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Lhx3P50481 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lhx3P50481 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lhx3P50481 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lhx3P50481 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lhx3P50481 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lhx3P50481 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lhx3P50481 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lhx3P50481 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lhx3P50481 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lhx3P50481 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lhx3P50481 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lhx3P50481 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lhx3P50481 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lhx3P50481 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lhx3P50481 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lhx3P50481 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lhx3P50481 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lhx3P50481 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms