Protein–RNA interactions for Protein: P49817

Cav1, Caveolin-1, mousemouse

Predictions only

Length 178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cav1P49817 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cav1P49817 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cav1P49817 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cav1P49817 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cav1P49817 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cav1P49817 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cav1P49817 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cav1P49817 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cav1P49817 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cav1P49817 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cav1P49817 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Cav1P49817 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cav1P49817 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cav1P49817 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cav1P49817 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cav1P49817 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cav1P49817 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cav1P49817 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cav1P49817 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cav1P49817 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cav1P49817 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cav1P49817 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cav1P49817 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cav1P49817 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cav1P49817 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Cav1P49817 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cav1P49817 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cav1P49817 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cav1P49817 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cav1P49817 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cav1P49817 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cav1P49817 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cav1P49817 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cav1P49817 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cav1P49817 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cav1P49817 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cav1P49817 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cav1P49817 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cav1P49817 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cav1P49817 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cav1P49817 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cav1P49817 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cav1P49817 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cav1P49817 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cav1P49817 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cav1P49817 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cav1P49817 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cav1P49817 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cav1P49817 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cav1P49817 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cav1P49817 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cav1P49817 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cav1P49817 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cav1P49817 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cav1P49817 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cav1P49817 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Cav1P49817 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cav1P49817 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cav1P49817 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Cav1P49817 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cav1P49817 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cav1P49817 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cav1P49817 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cav1P49817 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cav1P49817 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cav1P49817 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cav1P49817 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cav1P49817 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cav1P49817 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cav1P49817 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cav1P49817 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cav1P49817 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Cav1P49817 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cav1P49817 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cav1P49817 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cav1P49817 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cav1P49817 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Cav1P49817 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Cav1P49817 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cav1P49817 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cav1P49817 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cav1P49817 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Cav1P49817 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cav1P49817 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cav1P49817 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cav1P49817 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cav1P49817 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cav1P49817 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Cav1P49817 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Cav1P49817 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cav1P49817 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cav1P49817 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Cav1P49817 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cav1P49817 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cav1P49817 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cav1P49817 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cav1P49817 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cav1P49817 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cav1P49817 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cav1P49817 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.6 ms