Protein–RNA interactions for Protein: P49710

Hcls1, Hematopoietic lineage cell-specific protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 486 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hcls1P49710 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Hcls1P49710 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Hcls1P49710 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Hcls1P49710 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Hcls1P49710 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Hcls1P49710 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Hcls1P49710 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Hcls1P49710 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Hcls1P49710 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Hcls1P49710 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Hcls1P49710 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Hcls1P49710 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Hcls1P49710 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hcls1P49710 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hcls1P49710 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hcls1P49710 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hcls1P49710 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hcls1P49710 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hcls1P49710 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Hcls1P49710 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hcls1P49710 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hcls1P49710 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hcls1P49710 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hcls1P49710 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hcls1P49710 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hcls1P49710 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hcls1P49710 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hcls1P49710 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hcls1P49710 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hcls1P49710 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hcls1P49710 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Hcls1P49710 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hcls1P49710 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hcls1P49710 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hcls1P49710 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hcls1P49710 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Hcls1P49710 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hcls1P49710 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hcls1P49710 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hcls1P49710 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hcls1P49710 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hcls1P49710 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hcls1P49710 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hcls1P49710 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hcls1P49710 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hcls1P49710 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hcls1P49710 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hcls1P49710 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hcls1P49710 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hcls1P49710 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hcls1P49710 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hcls1P49710 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hcls1P49710 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hcls1P49710 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hcls1P49710 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Hcls1P49710 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hcls1P49710 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hcls1P49710 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hcls1P49710 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hcls1P49710 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Hcls1P49710 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Hcls1P49710 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Hcls1P49710 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Hcls1P49710 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15□□□□□ -0.01
Hcls1P49710 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Hcls1P49710 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Hcls1P49710 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hcls1P49710 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hcls1P49710 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hcls1P49710 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hcls1P49710 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hcls1P49710 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hcls1P49710 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Hcls1P49710 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hcls1P49710 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hcls1P49710 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hcls1P49710 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hcls1P49710 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hcls1P49710 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hcls1P49710 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hcls1P49710 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hcls1P49710 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hcls1P49710 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hcls1P49710 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hcls1P49710 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hcls1P49710 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hcls1P49710 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hcls1P49710 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hcls1P49710 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hcls1P49710 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hcls1P49710 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hcls1P49710 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hcls1P49710 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hcls1P49710 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hcls1P49710 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hcls1P49710 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hcls1P49710 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hcls1P49710 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hcls1P49710 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hcls1P49710 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms