Protein–RNA interactions for Protein: P49135

Ercc3, General transcription and DNA repair factor IIH helicase subunit XPB, mousemouse

Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc3P49135 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ercc3P49135 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ercc3P49135 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ercc3P49135 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ercc3P49135 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ercc3P49135 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ercc3P49135 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ercc3P49135 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ercc3P49135 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ercc3P49135 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ercc3P49135 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ercc3P49135 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ercc3P49135 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ercc3P49135 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Ercc3P49135 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ercc3P49135 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ercc3P49135 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ercc3P49135 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ercc3P49135 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ercc3P49135 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ercc3P49135 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ercc3P49135 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ercc3P49135 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ercc3P49135 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ercc3P49135 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ercc3P49135 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ercc3P49135 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Ercc3P49135 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Ercc3P49135 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ercc3P49135 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ercc3P49135 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ercc3P49135 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ercc3P49135 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ercc3P49135 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ercc3P49135 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ercc3P49135 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ercc3P49135 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ercc3P49135 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ercc3P49135 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ercc3P49135 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ercc3P49135 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ercc3P49135 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ercc3P49135 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ercc3P49135 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ercc3P49135 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ercc3P49135 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ercc3P49135 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ercc3P49135 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ercc3P49135 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ercc3P49135 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ercc3P49135 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ercc3P49135 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ercc3P49135 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Ercc3P49135 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ercc3P49135 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Ercc3P49135 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ercc3P49135 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ercc3P49135 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ercc3P49135 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Ercc3P49135 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ercc3P49135 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ercc3P49135 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ercc3P49135 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ercc3P49135 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ercc3P49135 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ercc3P49135 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ercc3P49135 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ercc3P49135 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ercc3P49135 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ercc3P49135 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ercc3P49135 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ercc3P49135 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ercc3P49135 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Ercc3P49135 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Ercc3P49135 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ercc3P49135 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Ercc3P49135 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ercc3P49135 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ercc3P49135 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ercc3P49135 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Ercc3P49135 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ercc3P49135 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ercc3P49135 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ercc3P49135 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ercc3P49135 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ercc3P49135 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ercc3P49135 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ercc3P49135 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ercc3P49135 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ercc3P49135 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ercc3P49135 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ercc3P49135 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ercc3P49135 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ercc3P49135 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ercc3P49135 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ercc3P49135 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ercc3P49135 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ercc3P49135 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ercc3P49135 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ercc3P49135 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms