Protein–RNA interactions for Protein: P48725

Pcnt, Pericentrin, mousemouse

Predictions only

Length 2,898 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcntP48725 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PcntP48725 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PcntP48725 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PcntP48725 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PcntP48725 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PcntP48725 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PcntP48725 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PcntP48725 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PcntP48725 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PcntP48725 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PcntP48725 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PcntP48725 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PcntP48725 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PcntP48725 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PcntP48725 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PcntP48725 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PcntP48725 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PcntP48725 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PcntP48725 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PcntP48725 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PcntP48725 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PcntP48725 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PcntP48725 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PcntP48725 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PcntP48725 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PcntP48725 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PcntP48725 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PcntP48725 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PcntP48725 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PcntP48725 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PcntP48725 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PcntP48725 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PcntP48725 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PcntP48725 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PcntP48725 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PcntP48725 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PcntP48725 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PcntP48725 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PcntP48725 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PcntP48725 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PcntP48725 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PcntP48725 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PcntP48725 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PcntP48725 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PcntP48725 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PcntP48725 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PcntP48725 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PcntP48725 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PcntP48725 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PcntP48725 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PcntP48725 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PcntP48725 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PcntP48725 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PcntP48725 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PcntP48725 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PcntP48725 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PcntP48725 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PcntP48725 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PcntP48725 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PcntP48725 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PcntP48725 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PcntP48725 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PcntP48725 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PcntP48725 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PcntP48725 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PcntP48725 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PcntP48725 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PcntP48725 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PcntP48725 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PcntP48725 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PcntP48725 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PcntP48725 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PcntP48725 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PcntP48725 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PcntP48725 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PcntP48725 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PcntP48725 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PcntP48725 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PcntP48725 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PcntP48725 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PcntP48725 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PcntP48725 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PcntP48725 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PcntP48725 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PcntP48725 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PcntP48725 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PcntP48725 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PcntP48725 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PcntP48725 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PcntP48725 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PcntP48725 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PcntP48725 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PcntP48725 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PcntP48725 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PcntP48725 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PcntP48725 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PcntP48725 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PcntP48725 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PcntP48725 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PcntP48725 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms