Protein–RNA interactions for Protein: P47867

Scg3, Secretogranin-3, mousemouse

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scg3P47867 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scg3P47867 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scg3P47867 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scg3P47867 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scg3P47867 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scg3P47867 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scg3P47867 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scg3P47867 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scg3P47867 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scg3P47867 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scg3P47867 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scg3P47867 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scg3P47867 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scg3P47867 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scg3P47867 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scg3P47867 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scg3P47867 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scg3P47867 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scg3P47867 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scg3P47867 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scg3P47867 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scg3P47867 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scg3P47867 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scg3P47867 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scg3P47867 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scg3P47867 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scg3P47867 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scg3P47867 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scg3P47867 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scg3P47867 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scg3P47867 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scg3P47867 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scg3P47867 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Scg3P47867 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scg3P47867 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scg3P47867 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scg3P47867 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scg3P47867 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scg3P47867 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Scg3P47867 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scg3P47867 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scg3P47867 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scg3P47867 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scg3P47867 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scg3P47867 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scg3P47867 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scg3P47867 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scg3P47867 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scg3P47867 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scg3P47867 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scg3P47867 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scg3P47867 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scg3P47867 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scg3P47867 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scg3P47867 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scg3P47867 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scg3P47867 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scg3P47867 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scg3P47867 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scg3P47867 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scg3P47867 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scg3P47867 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scg3P47867 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scg3P47867 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scg3P47867 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scg3P47867 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Scg3P47867 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Scg3P47867 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scg3P47867 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scg3P47867 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scg3P47867 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scg3P47867 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scg3P47867 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scg3P47867 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scg3P47867 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scg3P47867 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scg3P47867 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scg3P47867 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scg3P47867 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scg3P47867 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scg3P47867 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scg3P47867 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scg3P47867 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scg3P47867 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Scg3P47867 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Scg3P47867 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Scg3P47867 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Scg3P47867 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Scg3P47867 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Scg3P47867 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Scg3P47867 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Scg3P47867 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Scg3P47867 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Scg3P47867 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Scg3P47867 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Scg3P47867 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Scg3P47867 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Scg3P47867 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Scg3P47867 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Scg3P47867 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms