Protein–RNA interactions for Protein: P47806

Gli1, Zinc finger protein GLI1, mousemouse

Predictions only

Length 1,111 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli1P47806 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gli1P47806 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gli1P47806 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gli1P47806 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gli1P47806 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gli1P47806 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gli1P47806 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gli1P47806 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gli1P47806 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Gli1P47806 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gli1P47806 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gli1P47806 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Gli1P47806 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gli1P47806 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gli1P47806 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gli1P47806 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gli1P47806 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gli1P47806 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gli1P47806 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gli1P47806 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gli1P47806 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gli1P47806 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gli1P47806 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gli1P47806 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gli1P47806 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gli1P47806 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gli1P47806 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gli1P47806 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gli1P47806 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gli1P47806 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gli1P47806 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gli1P47806 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gli1P47806 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gli1P47806 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gli1P47806 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gli1P47806 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gli1P47806 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gli1P47806 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gli1P47806 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gli1P47806 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gli1P47806 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Gli1P47806 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gli1P47806 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gli1P47806 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gli1P47806 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gli1P47806 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gli1P47806 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gli1P47806 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gli1P47806 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gli1P47806 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gli1P47806 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gli1P47806 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gli1P47806 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gli1P47806 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Gli1P47806 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gli1P47806 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gli1P47806 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gli1P47806 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gli1P47806 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gli1P47806 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gli1P47806 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gli1P47806 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gli1P47806 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gli1P47806 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gli1P47806 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gli1P47806 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gli1P47806 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gli1P47806 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gli1P47806 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gli1P47806 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gli1P47806 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gli1P47806 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gli1P47806 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gli1P47806 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gli1P47806 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gli1P47806 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gli1P47806 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gli1P47806 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gli1P47806 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gli1P47806 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gli1P47806 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gli1P47806 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Gli1P47806 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gli1P47806 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Gli1P47806 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gli1P47806 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gli1P47806 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Gli1P47806 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Gli1P47806 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gli1P47806 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gli1P47806 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gli1P47806 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gli1P47806 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gli1P47806 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gli1P47806 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gli1P47806 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gli1P47806 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gli1P47806 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gli1P47806 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gli1P47806 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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