Protein–RNA interactions for Protein: P47758

Srprb, Signal recognition particle receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrprbP47758 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SrprbP47758 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SrprbP47758 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SrprbP47758 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SrprbP47758 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SrprbP47758 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SrprbP47758 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SrprbP47758 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SrprbP47758 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SrprbP47758 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SrprbP47758 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SrprbP47758 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SrprbP47758 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SrprbP47758 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SrprbP47758 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SrprbP47758 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SrprbP47758 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SrprbP47758 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SrprbP47758 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SrprbP47758 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SrprbP47758 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SrprbP47758 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SrprbP47758 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SrprbP47758 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SrprbP47758 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SrprbP47758 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SrprbP47758 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SrprbP47758 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SrprbP47758 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SrprbP47758 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SrprbP47758 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SrprbP47758 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SrprbP47758 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SrprbP47758 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SrprbP47758 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SrprbP47758 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SrprbP47758 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SrprbP47758 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SrprbP47758 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SrprbP47758 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SrprbP47758 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SrprbP47758 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SrprbP47758 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SrprbP47758 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SrprbP47758 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SrprbP47758 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SrprbP47758 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SrprbP47758 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SrprbP47758 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SrprbP47758 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SrprbP47758 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SrprbP47758 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
SrprbP47758 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SrprbP47758 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SrprbP47758 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SrprbP47758 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SrprbP47758 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SrprbP47758 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SrprbP47758 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SrprbP47758 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SrprbP47758 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SrprbP47758 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SrprbP47758 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SrprbP47758 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SrprbP47758 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SrprbP47758 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
SrprbP47758 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SrprbP47758 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SrprbP47758 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SrprbP47758 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SrprbP47758 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SrprbP47758 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SrprbP47758 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SrprbP47758 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SrprbP47758 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SrprbP47758 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
SrprbP47758 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
SrprbP47758 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SrprbP47758 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SrprbP47758 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SrprbP47758 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SrprbP47758 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SrprbP47758 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SrprbP47758 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SrprbP47758 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SrprbP47758 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SrprbP47758 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SrprbP47758 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SrprbP47758 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SrprbP47758 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SrprbP47758 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SrprbP47758 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SrprbP47758 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SrprbP47758 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SrprbP47758 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SrprbP47758 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SrprbP47758 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SrprbP47758 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
SrprbP47758 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SrprbP47758 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms