Protein–RNA interactions for Protein: P46099

Klf1, Krueppel-like factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf1P46099 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Klf1P46099 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Klf1P46099 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Klf1P46099 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Klf1P46099 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Klf1P46099 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Klf1P46099 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Klf1P46099 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Klf1P46099 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Klf1P46099 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Klf1P46099 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Klf1P46099 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Klf1P46099 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Klf1P46099 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Klf1P46099 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Klf1P46099 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Klf1P46099 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Klf1P46099 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Klf1P46099 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Klf1P46099 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Klf1P46099 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Klf1P46099 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Klf1P46099 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Klf1P46099 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Klf1P46099 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Klf1P46099 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Klf1P46099 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Klf1P46099 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Klf1P46099 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Klf1P46099 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Klf1P46099 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Klf1P46099 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Klf1P46099 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Klf1P46099 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Klf1P46099 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Klf1P46099 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Klf1P46099 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Klf1P46099 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Klf1P46099 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Klf1P46099 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Klf1P46099 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Klf1P46099 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Klf1P46099 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Klf1P46099 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Klf1P46099 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Klf1P46099 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Klf1P46099 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Klf1P46099 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Klf1P46099 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Klf1P46099 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Klf1P46099 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Klf1P46099 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Klf1P46099 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Klf1P46099 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Klf1P46099 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Klf1P46099 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Klf1P46099 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Klf1P46099 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Klf1P46099 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Klf1P46099 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Klf1P46099 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Klf1P46099 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Klf1P46099 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Klf1P46099 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Klf1P46099 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Klf1P46099 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Klf1P46099 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Klf1P46099 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Klf1P46099 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Klf1P46099 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Klf1P46099 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Klf1P46099 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Klf1P46099 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Klf1P46099 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Klf1P46099 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Klf1P46099 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Klf1P46099 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Klf1P46099 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Klf1P46099 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Klf1P46099 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Klf1P46099 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Klf1P46099 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Klf1P46099 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Klf1P46099 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Klf1P46099 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Klf1P46099 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Klf1P46099 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Klf1P46099 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Klf1P46099 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Klf1P46099 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Klf1P46099 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Klf1P46099 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Klf1P46099 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Klf1P46099 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Klf1P46099 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Klf1P46099 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Klf1P46099 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Klf1P46099 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Klf1P46099 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Klf1P46099 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms