Protein–RNA interactions for Protein: P46096

Syt1, Synaptotagmin-1, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syt1P46096 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Syt1P46096 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Syt1P46096 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Syt1P46096 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Syt1P46096 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Syt1P46096 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Syt1P46096 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Syt1P46096 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Syt1P46096 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Syt1P46096 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Syt1P46096 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Syt1P46096 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Syt1P46096 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Syt1P46096 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Syt1P46096 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Syt1P46096 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Syt1P46096 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Syt1P46096 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Syt1P46096 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Syt1P46096 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Syt1P46096 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Syt1P46096 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Syt1P46096 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Syt1P46096 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Syt1P46096 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Syt1P46096 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Syt1P46096 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Syt1P46096 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Syt1P46096 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Syt1P46096 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Syt1P46096 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Syt1P46096 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Syt1P46096 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Syt1P46096 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Syt1P46096 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Syt1P46096 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Syt1P46096 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Syt1P46096 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Syt1P46096 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Syt1P46096 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Syt1P46096 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Syt1P46096 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Syt1P46096 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Syt1P46096 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Syt1P46096 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Syt1P46096 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Syt1P46096 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Syt1P46096 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Syt1P46096 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Syt1P46096 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Syt1P46096 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Syt1P46096 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Syt1P46096 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Syt1P46096 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Syt1P46096 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Syt1P46096 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Syt1P46096 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Syt1P46096 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Syt1P46096 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Syt1P46096 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Syt1P46096 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Syt1P46096 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Syt1P46096 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Syt1P46096 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Syt1P46096 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Syt1P46096 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Syt1P46096 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Syt1P46096 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Syt1P46096 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Syt1P46096 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Syt1P46096 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Syt1P46096 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Syt1P46096 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Syt1P46096 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Syt1P46096 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Syt1P46096 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Syt1P46096 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Syt1P46096 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Syt1P46096 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Syt1P46096 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Syt1P46096 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Syt1P46096 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Syt1P46096 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Syt1P46096 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Syt1P46096 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Syt1P46096 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Syt1P46096 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Syt1P46096 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Syt1P46096 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Syt1P46096 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Syt1P46096 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Syt1P46096 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Syt1P46096 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Syt1P46096 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Syt1P46096 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Syt1P46096 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Syt1P46096 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Syt1P46096 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Syt1P46096 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Syt1P46096 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms