Protein–RNA interactions for Protein: P43345

Tlx1, T-cell leukemia homeobox protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 332 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlx1P43345 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tlx1P43345 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tlx1P43345 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tlx1P43345 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tlx1P43345 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tlx1P43345 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tlx1P43345 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tlx1P43345 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tlx1P43345 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tlx1P43345 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tlx1P43345 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tlx1P43345 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tlx1P43345 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tlx1P43345 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tlx1P43345 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tlx1P43345 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tlx1P43345 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tlx1P43345 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Tlx1P43345 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tlx1P43345 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tlx1P43345 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tlx1P43345 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tlx1P43345 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tlx1P43345 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tlx1P43345 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tlx1P43345 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tlx1P43345 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tlx1P43345 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tlx1P43345 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tlx1P43345 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tlx1P43345 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tlx1P43345 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tlx1P43345 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tlx1P43345 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tlx1P43345 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tlx1P43345 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tlx1P43345 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tlx1P43345 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tlx1P43345 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tlx1P43345 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tlx1P43345 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tlx1P43345 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tlx1P43345 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tlx1P43345 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Tlx1P43345 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tlx1P43345 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tlx1P43345 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tlx1P43345 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tlx1P43345 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tlx1P43345 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tlx1P43345 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tlx1P43345 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tlx1P43345 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tlx1P43345 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tlx1P43345 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tlx1P43345 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tlx1P43345 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tlx1P43345 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tlx1P43345 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tlx1P43345 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tlx1P43345 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tlx1P43345 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tlx1P43345 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tlx1P43345 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tlx1P43345 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tlx1P43345 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tlx1P43345 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tlx1P43345 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tlx1P43345 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tlx1P43345 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tlx1P43345 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tlx1P43345 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Tlx1P43345 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tlx1P43345 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tlx1P43345 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tlx1P43345 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tlx1P43345 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tlx1P43345 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tlx1P43345 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tlx1P43345 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Tlx1P43345 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Tlx1P43345 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tlx1P43345 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tlx1P43345 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tlx1P43345 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tlx1P43345 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tlx1P43345 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tlx1P43345 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tlx1P43345 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tlx1P43345 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tlx1P43345 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tlx1P43345 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tlx1P43345 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tlx1P43345 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tlx1P43345 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tlx1P43345 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tlx1P43345 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tlx1P43345 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tlx1P43345 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tlx1P43345 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms