Protein–RNA interactions for Protein: P43117

Ptgfr, Prostaglandin F2-alpha receptor, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtgfrP43117 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PtgfrP43117 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PtgfrP43117 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PtgfrP43117 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PtgfrP43117 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PtgfrP43117 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PtgfrP43117 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PtgfrP43117 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PtgfrP43117 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PtgfrP43117 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PtgfrP43117 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PtgfrP43117 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
PtgfrP43117 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PtgfrP43117 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PtgfrP43117 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PtgfrP43117 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PtgfrP43117 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PtgfrP43117 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PtgfrP43117 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PtgfrP43117 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PtgfrP43117 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PtgfrP43117 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PtgfrP43117 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PtgfrP43117 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PtgfrP43117 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PtgfrP43117 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PtgfrP43117 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PtgfrP43117 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PtgfrP43117 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PtgfrP43117 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PtgfrP43117 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PtgfrP43117 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PtgfrP43117 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PtgfrP43117 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PtgfrP43117 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PtgfrP43117 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PtgfrP43117 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PtgfrP43117 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PtgfrP43117 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PtgfrP43117 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PtgfrP43117 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PtgfrP43117 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PtgfrP43117 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PtgfrP43117 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PtgfrP43117 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PtgfrP43117 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PtgfrP43117 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PtgfrP43117 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PtgfrP43117 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PtgfrP43117 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PtgfrP43117 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PtgfrP43117 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PtgfrP43117 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
PtgfrP43117 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PtgfrP43117 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PtgfrP43117 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PtgfrP43117 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PtgfrP43117 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PtgfrP43117 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
PtgfrP43117 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PtgfrP43117 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PtgfrP43117 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PtgfrP43117 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PtgfrP43117 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PtgfrP43117 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PtgfrP43117 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PtgfrP43117 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PtgfrP43117 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PtgfrP43117 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PtgfrP43117 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PtgfrP43117 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PtgfrP43117 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PtgfrP43117 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PtgfrP43117 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PtgfrP43117 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PtgfrP43117 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PtgfrP43117 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PtgfrP43117 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PtgfrP43117 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PtgfrP43117 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PtgfrP43117 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PtgfrP43117 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PtgfrP43117 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PtgfrP43117 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PtgfrP43117 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PtgfrP43117 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PtgfrP43117 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PtgfrP43117 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PtgfrP43117 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PtgfrP43117 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PtgfrP43117 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PtgfrP43117 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PtgfrP43117 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PtgfrP43117 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PtgfrP43117 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PtgfrP43117 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PtgfrP43117 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PtgfrP43117 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PtgfrP43117 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PtgfrP43117 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms