Protein–RNA interactions for Protein: P41245

Mmp9, Matrix metalloproteinase-9, mousemouse

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Length 730 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp9P41245 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Mmp9P41245 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Mmp9P41245 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Mmp9P41245 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Mmp9P41245 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Mmp9P41245 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Mmp9P41245 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Mmp9P41245 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Mmp9P41245 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Mmp9P41245 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Mmp9P41245 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Mmp9P41245 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Mmp9P41245 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Mmp9P41245 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Mmp9P41245 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Mmp9P41245 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Mmp9P41245 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Mmp9P41245 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Mmp9P41245 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Mmp9P41245 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Mmp9P41245 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Mmp9P41245 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Mmp9P41245 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Mmp9P41245 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Mmp9P41245 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Mmp9P41245 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Mmp9P41245 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Mmp9P41245 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Mmp9P41245 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Mmp9P41245 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Mmp9P41245 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Mmp9P41245 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Mmp9P41245 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Mmp9P41245 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Mmp9P41245 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Mmp9P41245 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Mmp9P41245 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Mmp9P41245 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Mmp9P41245 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Mmp9P41245 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Mmp9P41245 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Mmp9P41245 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Mmp9P41245 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Mmp9P41245 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Mmp9P41245 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Mmp9P41245 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Mmp9P41245 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Mmp9P41245 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Mmp9P41245 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Mmp9P41245 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Mmp9P41245 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Mmp9P41245 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Mmp9P41245 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Mmp9P41245 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Mmp9P41245 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Mmp9P41245 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
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Mmp9P41245 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Mmp9P41245 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Mmp9P41245 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Mmp9P41245 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Mmp9P41245 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Mmp9P41245 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Mmp9P41245 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Mmp9P41245 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Mmp9P41245 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Mmp9P41245 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Mmp9P41245 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Mmp9P41245 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Mmp9P41245 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Mmp9P41245 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Mmp9P41245 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Mmp9P41245 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Mmp9P41245 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Mmp9P41245 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Mmp9P41245 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Mmp9P41245 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Mmp9P41245 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Mmp9P41245 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Mmp9P41245 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Mmp9P41245 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Mmp9P41245 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Mmp9P41245 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Mmp9P41245 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Mmp9P41245 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Mmp9P41245 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Mmp9P41245 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Mmp9P41245 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Mmp9P41245 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Mmp9P41245 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Mmp9P41245 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Mmp9P41245 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Mmp9P41245 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Mmp9P41245 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Mmp9P41245 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Mmp9P41245 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Mmp9P41245 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Mmp9P41245 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.39
Mmp9P41245 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Mmp9P41245 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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