Protein–RNA interactions for Protein: P40338

Vhl, von Hippel-Lindau disease tumor suppressor, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VhlP40338 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
VhlP40338 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
VhlP40338 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
VhlP40338 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
VhlP40338 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
VhlP40338 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
VhlP40338 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
VhlP40338 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
VhlP40338 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
VhlP40338 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
VhlP40338 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
VhlP40338 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
VhlP40338 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
VhlP40338 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
VhlP40338 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
VhlP40338 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
VhlP40338 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
VhlP40338 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
VhlP40338 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
VhlP40338 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
VhlP40338 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
VhlP40338 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
VhlP40338 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
VhlP40338 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
VhlP40338 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
VhlP40338 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
VhlP40338 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
VhlP40338 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
VhlP40338 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
VhlP40338 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
VhlP40338 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
VhlP40338 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
VhlP40338 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
VhlP40338 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
VhlP40338 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
VhlP40338 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
VhlP40338 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
VhlP40338 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
VhlP40338 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
VhlP40338 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
VhlP40338 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
VhlP40338 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
VhlP40338 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
VhlP40338 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
VhlP40338 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
VhlP40338 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
VhlP40338 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
VhlP40338 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
VhlP40338 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
VhlP40338 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
VhlP40338 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
VhlP40338 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
VhlP40338 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
VhlP40338 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
VhlP40338 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
VhlP40338 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
VhlP40338 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
VhlP40338 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
VhlP40338 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
VhlP40338 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
VhlP40338 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
VhlP40338 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
VhlP40338 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
VhlP40338 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
VhlP40338 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
VhlP40338 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
VhlP40338 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
VhlP40338 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
VhlP40338 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
VhlP40338 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
VhlP40338 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
VhlP40338 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
VhlP40338 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
VhlP40338 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
VhlP40338 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
VhlP40338 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
VhlP40338 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
VhlP40338 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
VhlP40338 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
VhlP40338 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
VhlP40338 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
VhlP40338 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
VhlP40338 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
VhlP40338 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
VhlP40338 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
VhlP40338 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
VhlP40338 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
VhlP40338 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
VhlP40338 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
VhlP40338 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
VhlP40338 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
VhlP40338 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
VhlP40338 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
VhlP40338 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
VhlP40338 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
VhlP40338 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
VhlP40338 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
VhlP40338 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
VhlP40338 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
VhlP40338 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms