Protein–RNA interactions for Protein: P37238

Pparg, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpargP37238 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PpargP37238 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PpargP37238 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PpargP37238 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PpargP37238 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PpargP37238 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PpargP37238 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PpargP37238 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PpargP37238 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PpargP37238 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PpargP37238 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PpargP37238 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PpargP37238 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PpargP37238 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PpargP37238 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PpargP37238 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PpargP37238 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PpargP37238 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PpargP37238 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PpargP37238 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PpargP37238 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PpargP37238 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PpargP37238 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PpargP37238 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PpargP37238 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PpargP37238 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PpargP37238 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PpargP37238 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PpargP37238 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PpargP37238 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PpargP37238 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PpargP37238 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PpargP37238 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PpargP37238 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PpargP37238 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PpargP37238 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PpargP37238 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PpargP37238 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PpargP37238 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PpargP37238 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PpargP37238 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PpargP37238 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PpargP37238 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PpargP37238 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PpargP37238 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PpargP37238 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PpargP37238 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PpargP37238 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PpargP37238 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PpargP37238 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PpargP37238 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PpargP37238 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PpargP37238 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PpargP37238 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PpargP37238 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PpargP37238 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PpargP37238 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PpargP37238 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PpargP37238 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PpargP37238 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PpargP37238 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PpargP37238 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PpargP37238 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PpargP37238 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PpargP37238 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PpargP37238 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
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PpargP37238 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PpargP37238 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PpargP37238 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PpargP37238 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PpargP37238 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PpargP37238 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PpargP37238 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PpargP37238 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PpargP37238 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PpargP37238 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PpargP37238 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PpargP37238 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PpargP37238 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PpargP37238 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PpargP37238 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PpargP37238 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PpargP37238 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PpargP37238 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PpargP37238 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PpargP37238 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PpargP37238 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PpargP37238 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PpargP37238 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PpargP37238 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PpargP37238 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PpargP37238 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PpargP37238 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PpargP37238 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PpargP37238 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PpargP37238 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PpargP37238 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PpargP37238 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PpargP37238 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.6 ms