Protein–RNA interactions for Protein: P33896

Ifnar1, Interferon alpha/beta receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 590 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifnar1P33896 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ifnar1P33896 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ifnar1P33896 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ifnar1P33896 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ifnar1P33896 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ifnar1P33896 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ifnar1P33896 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ifnar1P33896 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ifnar1P33896 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ifnar1P33896 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ifnar1P33896 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ifnar1P33896 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ifnar1P33896 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ifnar1P33896 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ifnar1P33896 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ifnar1P33896 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ifnar1P33896 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ifnar1P33896 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ifnar1P33896 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ifnar1P33896 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ifnar1P33896 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ifnar1P33896 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ifnar1P33896 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ifnar1P33896 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ifnar1P33896 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ifnar1P33896 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ifnar1P33896 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ifnar1P33896 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ifnar1P33896 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ifnar1P33896 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ifnar1P33896 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ifnar1P33896 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ifnar1P33896 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ifnar1P33896 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ifnar1P33896 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ifnar1P33896 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ifnar1P33896 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ifnar1P33896 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ifnar1P33896 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ifnar1P33896 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ifnar1P33896 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ifnar1P33896 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ifnar1P33896 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ifnar1P33896 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ifnar1P33896 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ifnar1P33896 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ifnar1P33896 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ifnar1P33896 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ifnar1P33896 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ifnar1P33896 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ifnar1P33896 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ifnar1P33896 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ifnar1P33896 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ifnar1P33896 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ifnar1P33896 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ifnar1P33896 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ifnar1P33896 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ifnar1P33896 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ifnar1P33896 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ifnar1P33896 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ifnar1P33896 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ifnar1P33896 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ifnar1P33896 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ifnar1P33896 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Ifnar1P33896 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ifnar1P33896 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ifnar1P33896 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Ifnar1P33896 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Ifnar1P33896 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ifnar1P33896 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ifnar1P33896 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ifnar1P33896 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Ifnar1P33896 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ifnar1P33896 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ifnar1P33896 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ifnar1P33896 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ifnar1P33896 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Ifnar1P33896 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ifnar1P33896 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ifnar1P33896 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ifnar1P33896 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ifnar1P33896 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ifnar1P33896 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ifnar1P33896 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ifnar1P33896 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ifnar1P33896 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ifnar1P33896 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ifnar1P33896 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ifnar1P33896 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ifnar1P33896 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ifnar1P33896 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ifnar1P33896 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ifnar1P33896 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ifnar1P33896 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ifnar1P33896 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ifnar1P33896 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ifnar1P33896 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ifnar1P33896 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ifnar1P33896 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ifnar1P33896 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms