Protein–RNA interactions for Protein: P32958

Rom1, Rod outer segment membrane protein 1, mousemouse

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Length 351 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rom1P32958 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rom1P32958 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rom1P32958 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rom1P32958 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rom1P32958 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rom1P32958 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rom1P32958 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Rom1P32958 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rom1P32958 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rom1P32958 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Rom1P32958 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rom1P32958 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Rom1P32958 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rom1P32958 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rom1P32958 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rom1P32958 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rom1P32958 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rom1P32958 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rom1P32958 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rom1P32958 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rom1P32958 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rom1P32958 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rom1P32958 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rom1P32958 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rom1P32958 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rom1P32958 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Rom1P32958 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rom1P32958 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rom1P32958 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rom1P32958 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rom1P32958 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rom1P32958 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rom1P32958 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rom1P32958 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rom1P32958 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rom1P32958 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rom1P32958 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rom1P32958 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rom1P32958 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rom1P32958 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rom1P32958 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rom1P32958 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rom1P32958 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Rom1P32958 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rom1P32958 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rom1P32958 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rom1P32958 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rom1P32958 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rom1P32958 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rom1P32958 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rom1P32958 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rom1P32958 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rom1P32958 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rom1P32958 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rom1P32958 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rom1P32958 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rom1P32958 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rom1P32958 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rom1P32958 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rom1P32958 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Rom1P32958 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rom1P32958 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rom1P32958 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rom1P32958 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rom1P32958 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rom1P32958 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rom1P32958 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rom1P32958 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rom1P32958 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rom1P32958 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rom1P32958 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rom1P32958 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Rom1P32958 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rom1P32958 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Rom1P32958 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rom1P32958 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rom1P32958 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rom1P32958 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rom1P32958 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rom1P32958 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rom1P32958 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rom1P32958 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Rom1P32958 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Rom1P32958 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rom1P32958 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rom1P32958 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rom1P32958 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rom1P32958 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rom1P32958 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rom1P32958 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rom1P32958 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rom1P32958 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rom1P32958 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Rom1P32958 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rom1P32958 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rom1P32958 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rom1P32958 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rom1P32958 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rom1P32958 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rom1P32958 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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