Protein–RNA interactions for Protein: P31257

Hoxc10, Homeobox protein Hox-C10, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc10P31257 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Hoxc10P31257 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Hoxc10P31257 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Hoxc10P31257 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Hoxc10P31257 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hoxc10P31257 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hoxc10P31257 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hoxc10P31257 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hoxc10P31257 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hoxc10P31257 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hoxc10P31257 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hoxc10P31257 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hoxc10P31257 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hoxc10P31257 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hoxc10P31257 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hoxc10P31257 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hoxc10P31257 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hoxc10P31257 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hoxc10P31257 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hoxc10P31257 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hoxc10P31257 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hoxc10P31257 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hoxc10P31257 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hoxc10P31257 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hoxc10P31257 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxc10P31257 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxc10P31257 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxc10P31257 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxc10P31257 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxc10P31257 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxc10P31257 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxc10P31257 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxc10P31257 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxc10P31257 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxc10P31257 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxc10P31257 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxc10P31257 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxc10P31257 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxc10P31257 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxc10P31257 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxc10P31257 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxc10P31257 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxc10P31257 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxc10P31257 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxc10P31257 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxc10P31257 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxc10P31257 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxc10P31257 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxc10P31257 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxc10P31257 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxc10P31257 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxc10P31257 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxc10P31257 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxc10P31257 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxc10P31257 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxc10P31257 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxc10P31257 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxc10P31257 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Hoxc10P31257 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Hoxc10P31257 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxc10P31257 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxc10P31257 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Hoxc10P31257 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxc10P31257 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxc10P31257 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxc10P31257 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxc10P31257 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxc10P31257 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxc10P31257 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxc10P31257 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxc10P31257 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxc10P31257 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxc10P31257 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxc10P31257 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxc10P31257 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxc10P31257 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxc10P31257 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxc10P31257 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxc10P31257 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxc10P31257 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxc10P31257 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxc10P31257 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxc10P31257 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxc10P31257 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxc10P31257 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxc10P31257 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxc10P31257 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxc10P31257 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxc10P31257 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxc10P31257 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxc10P31257 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxc10P31257 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxc10P31257 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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