Protein–RNA interactions for Protein: P28230

Gjb1, Gap junction beta-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb1P28230 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gjb1P28230 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gjb1P28230 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gjb1P28230 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gjb1P28230 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gjb1P28230 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gjb1P28230 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gjb1P28230 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Gjb1P28230 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Gjb1P28230 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Gjb1P28230 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gjb1P28230 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gjb1P28230 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gjb1P28230 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gjb1P28230 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gjb1P28230 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gjb1P28230 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gjb1P28230 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gjb1P28230 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gjb1P28230 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gjb1P28230 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gjb1P28230 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gjb1P28230 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gjb1P28230 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gjb1P28230 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gjb1P28230 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Gjb1P28230 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Gjb1P28230 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Gjb1P28230 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gjb1P28230 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gjb1P28230 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gjb1P28230 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gjb1P28230 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Gjb1P28230 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gjb1P28230 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gjb1P28230 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gjb1P28230 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gjb1P28230 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gjb1P28230 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gjb1P28230 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gjb1P28230 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gjb1P28230 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gjb1P28230 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gjb1P28230 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gjb1P28230 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gjb1P28230 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gjb1P28230 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gjb1P28230 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gjb1P28230 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gjb1P28230 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gjb1P28230 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Gjb1P28230 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Gjb1P28230 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gjb1P28230 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Gjb1P28230 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gjb1P28230 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gjb1P28230 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gjb1P28230 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gjb1P28230 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gjb1P28230 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gjb1P28230 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gjb1P28230 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gjb1P28230 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gjb1P28230 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gjb1P28230 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Gjb1P28230 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Gjb1P28230 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Gjb1P28230 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Gjb1P28230 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Gjb1P28230 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gjb1P28230 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gjb1P28230 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gjb1P28230 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gjb1P28230 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gjb1P28230 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gjb1P28230 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Gjb1P28230 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gjb1P28230 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gjb1P28230 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gjb1P28230 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gjb1P28230 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gjb1P28230 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gjb1P28230 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gjb1P28230 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gjb1P28230 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gjb1P28230 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gjb1P28230 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gjb1P28230 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gjb1P28230 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gjb1P28230 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gjb1P28230 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gjb1P28230 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gjb1P28230 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gjb1P28230 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gjb1P28230 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gjb1P28230 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gjb1P28230 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gjb1P28230 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gjb1P28230 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gjb1P28230 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms