Protein–RNA interactions for Protein: P28028

Braf, Serine/threonine-protein kinase B-raf, mousemouse

Predictions only

Length 804 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BrafP28028 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
BrafP28028 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
BrafP28028 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
BrafP28028 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
BrafP28028 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
BrafP28028 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
BrafP28028 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
BrafP28028 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
BrafP28028 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
BrafP28028 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
BrafP28028 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
BrafP28028 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
BrafP28028 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
BrafP28028 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
BrafP28028 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
BrafP28028 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
BrafP28028 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
BrafP28028 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
BrafP28028 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
BrafP28028 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
BrafP28028 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
BrafP28028 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
BrafP28028 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
BrafP28028 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
BrafP28028 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
BrafP28028 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
BrafP28028 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
BrafP28028 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
BrafP28028 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
BrafP28028 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
BrafP28028 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
BrafP28028 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
BrafP28028 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
BrafP28028 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
BrafP28028 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
BrafP28028 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
BrafP28028 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
BrafP28028 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
BrafP28028 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
BrafP28028 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
BrafP28028 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
BrafP28028 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
BrafP28028 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
BrafP28028 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
BrafP28028 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
BrafP28028 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
BrafP28028 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
BrafP28028 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
BrafP28028 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
BrafP28028 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
BrafP28028 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
BrafP28028 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
BrafP28028 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
BrafP28028 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
BrafP28028 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
BrafP28028 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
BrafP28028 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
BrafP28028 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
BrafP28028 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
BrafP28028 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
BrafP28028 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
BrafP28028 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
BrafP28028 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
BrafP28028 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
BrafP28028 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
BrafP28028 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
BrafP28028 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
BrafP28028 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
BrafP28028 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
BrafP28028 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
BrafP28028 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
BrafP28028 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
BrafP28028 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
BrafP28028 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
BrafP28028 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
BrafP28028 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
BrafP28028 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
BrafP28028 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
BrafP28028 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
BrafP28028 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
BrafP28028 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
BrafP28028 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
BrafP28028 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
BrafP28028 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
BrafP28028 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
BrafP28028 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
BrafP28028 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
BrafP28028 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
BrafP28028 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
BrafP28028 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
BrafP28028 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
BrafP28028 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
BrafP28028 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
BrafP28028 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
BrafP28028 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
BrafP28028 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
BrafP28028 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
BrafP28028 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
BrafP28028 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
BrafP28028 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
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