Protein–RNA interactions for Protein: P27870

Vav1, Proto-oncogene vav, mousemouse

Predictions only

Length 845 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vav1P27870 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vav1P27870 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vav1P27870 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vav1P27870 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vav1P27870 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vav1P27870 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vav1P27870 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vav1P27870 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vav1P27870 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vav1P27870 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vav1P27870 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vav1P27870 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vav1P27870 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vav1P27870 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vav1P27870 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vav1P27870 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vav1P27870 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vav1P27870 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vav1P27870 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vav1P27870 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Vav1P27870 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vav1P27870 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vav1P27870 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vav1P27870 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vav1P27870 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vav1P27870 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vav1P27870 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vav1P27870 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vav1P27870 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vav1P27870 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vav1P27870 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vav1P27870 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vav1P27870 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vav1P27870 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vav1P27870 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vav1P27870 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vav1P27870 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vav1P27870 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vav1P27870 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Vav1P27870 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vav1P27870 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vav1P27870 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vav1P27870 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vav1P27870 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vav1P27870 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vav1P27870 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vav1P27870 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vav1P27870 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vav1P27870 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vav1P27870 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vav1P27870 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vav1P27870 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vav1P27870 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vav1P27870 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vav1P27870 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vav1P27870 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vav1P27870 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Vav1P27870 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Vav1P27870 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Vav1P27870 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Vav1P27870 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vav1P27870 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Vav1P27870 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vav1P27870 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vav1P27870 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vav1P27870 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vav1P27870 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vav1P27870 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vav1P27870 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vav1P27870 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vav1P27870 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vav1P27870 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vav1P27870 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vav1P27870 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Vav1P27870 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vav1P27870 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vav1P27870 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vav1P27870 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vav1P27870 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vav1P27870 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vav1P27870 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Vav1P27870 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vav1P27870 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vav1P27870 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vav1P27870 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vav1P27870 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vav1P27870 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vav1P27870 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vav1P27870 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vav1P27870 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Vav1P27870 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Vav1P27870 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Vav1P27870 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Vav1P27870 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vav1P27870 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vav1P27870 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vav1P27870 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vav1P27870 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vav1P27870 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vav1P27870 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.7 ms