Protein–RNA interactions for Protein: P27661

H2afx, Histone H2AX, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2afxP27661 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2afxP27661 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2afxP27661 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2afxP27661 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2afxP27661 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2afxP27661 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2afxP27661 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2afxP27661 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2afxP27661 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2afxP27661 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2afxP27661 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2afxP27661 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2afxP27661 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
H2afxP27661 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2afxP27661 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2afxP27661 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2afxP27661 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2afxP27661 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2afxP27661 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2afxP27661 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2afxP27661 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2afxP27661 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2afxP27661 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
H2afxP27661 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
H2afxP27661 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2afxP27661 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2afxP27661 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2afxP27661 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2afxP27661 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
H2afxP27661 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2afxP27661 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2afxP27661 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2afxP27661 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2afxP27661 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2afxP27661 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2afxP27661 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2afxP27661 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2afxP27661 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2afxP27661 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2afxP27661 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2afxP27661 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2afxP27661 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2afxP27661 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2afxP27661 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2afxP27661 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
H2afxP27661 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2afxP27661 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2afxP27661 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
H2afxP27661 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2afxP27661 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2afxP27661 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2afxP27661 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2afxP27661 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2afxP27661 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2afxP27661 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2afxP27661 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2afxP27661 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2afxP27661 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
H2afxP27661 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
H2afxP27661 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
H2afxP27661 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
H2afxP27661 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
H2afxP27661 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
H2afxP27661 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
H2afxP27661 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
H2afxP27661 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
H2afxP27661 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
H2afxP27661 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
H2afxP27661 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
H2afxP27661 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
H2afxP27661 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
H2afxP27661 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
H2afxP27661 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
H2afxP27661 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
H2afxP27661 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
H2afxP27661 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
H2afxP27661 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
H2afxP27661 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
H2afxP27661 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
H2afxP27661 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
H2afxP27661 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
H2afxP27661 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
H2afxP27661 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
H2afxP27661 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
H2afxP27661 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
H2afxP27661 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
H2afxP27661 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
H2afxP27661 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
H2afxP27661 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
H2afxP27661 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
H2afxP27661 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
H2afxP27661 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
H2afxP27661 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
H2afxP27661 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
H2afxP27661 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
H2afxP27661 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
H2afxP27661 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
H2afxP27661 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
H2afxP27661 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
H2afxP27661 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms