Protein–RNA interactions for Protein: P23813

Hoxd11, Homeobox protein Hox-D11, mousemouse

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Length 323 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd11P23813 Gm35206-201ENSMUST00000217945 1642 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxd11P23813 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxd11P23813 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxd11P23813 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxd11P23813 Gm14409-201ENSMUST00000108963 1050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxd11P23813 Gm26254-201ENSMUST00000122491 118 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxd11P23813 Dcdc5-203ENSMUST00000126340 396 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxd11P23813 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxd11P23813 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxd11P23813 Gm19224-201ENSMUST00000190477 793 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxd11P23813 Gm38019-201ENSMUST00000195133 380 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxd11P23813 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxd11P23813 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxd11P23813 Gm44693-201ENSMUST00000208141 460 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxd11P23813 Cwc15-202ENSMUST00000213913 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxd11P23813 3830406C13Rik-217ENSMUST00000225773 417 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxd11P23813 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxd11P23813 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxd11P23813 Cbx1-203ENSMUST00000093943 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxd11P23813 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxd11P23813 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxd11P23813 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxd11P23813 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hoxd11P23813 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hoxd11P23813 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hoxd11P23813 AU019990-202ENSMUST00000143964 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hoxd11P23813 AC131120.1-201ENSMUST00000217728 1617 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Hoxd11P23813 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hoxd11P23813 Gm15185-201ENSMUST00000117397 746 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Hoxd11P23813 Gm12477-201ENSMUST00000121221 571 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Hoxd11P23813 Gm12444-201ENSMUST00000121512 877 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Hoxd11P23813 Pramef12os-201ENSMUST00000133334 767 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hoxd11P23813 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hoxd11P23813 Nup37-202ENSMUST00000169309 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hoxd11P23813 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hoxd11P23813 Gm9947-202ENSMUST00000187401 687 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hoxd11P23813 Gm2622-201ENSMUST00000200018 471 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Hoxd11P23813 Gm43895-201ENSMUST00000203219 855 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Hoxd11P23813 AC118230.1-201ENSMUST00000220196 656 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Hoxd11P23813 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hoxd11P23813 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hoxd11P23813 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hoxd11P23813 Olfr310-201ENSMUST00000081918 1082 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hoxd11P23813 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hoxd11P23813 Olfr552-201ENSMUST00000098223 954 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hoxd11P23813 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Hoxd11P23813 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hoxd11P23813 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hoxd11P23813 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hoxd11P23813 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hoxd11P23813 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hoxd11P23813 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hoxd11P23813 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hoxd11P23813 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hoxd11P23813 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Hoxd11P23813 Anp32-ps-201ENSMUST00000118265 388 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Hoxd11P23813 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hoxd11P23813 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hoxd11P23813 Tctex1d1-205ENSMUST00000140654 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hoxd11P23813 Gm11269-201ENSMUST00000157011 595 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hoxd11P23813 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Hoxd11P23813 Prr13-202ENSMUST00000164688 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hoxd11P23813 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hoxd11P23813 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hoxd11P23813 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Hoxd11P23813 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hoxd11P23813 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hoxd11P23813 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Hoxd11P23813 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hoxd11P23813 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hoxd11P23813 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hoxd11P23813 Gm42963-201ENSMUST00000202943 1217 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Hoxd11P23813 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hoxd11P23813 AC154851.1-201ENSMUST00000221591 655 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Hoxd11P23813 AC192616.1-201ENSMUST00000221922 132 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Hoxd11P23813 CT010575.2-201ENSMUST00000222876 496 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hoxd11P23813 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hoxd11P23813 Tas2r109-201ENSMUST00000067539 951 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hoxd11P23813 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hoxd11P23813 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Hoxd11P23813 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hoxd11P23813 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hoxd11P23813 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Hoxd11P23813 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Hoxd11P23813 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Hoxd11P23813 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxd11P23813 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxd11P23813 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxd11P23813 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxd11P23813 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxd11P23813 Lrrc69-202ENSMUST00000108276 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxd11P23813 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxd11P23813 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxd11P23813 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxd11P23813 Gm22730-201ENSMUST00000158085 171 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxd11P23813 Gm20417-201ENSMUST00000174784 425 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxd11P23813 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxd11P23813 Scgb1b6-ps-201ENSMUST00000185337 199 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxd11P23813 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxd11P23813 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
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