Protein–RNA interactions for Protein: P19182

Ifrd1, Interferon-related developmental regulator 1, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifrd1P19182 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ifrd1P19182 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ifrd1P19182 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ifrd1P19182 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ifrd1P19182 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ifrd1P19182 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ifrd1P19182 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ifrd1P19182 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ifrd1P19182 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Ifrd1P19182 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ifrd1P19182 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ifrd1P19182 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ifrd1P19182 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ifrd1P19182 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ifrd1P19182 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ifrd1P19182 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ifrd1P19182 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ifrd1P19182 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Ifrd1P19182 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ifrd1P19182 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ifrd1P19182 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.02■□□□□ -0
Ifrd1P19182 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ifrd1P19182 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ifrd1P19182 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ifrd1P19182 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ifrd1P19182 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ifrd1P19182 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.02■□□□□ -0
Ifrd1P19182 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ifrd1P19182 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ifrd1P19182 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ifrd1P19182 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ifrd1P19182 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ifrd1P19182 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ifrd1P19182 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ifrd1P19182 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ifrd1P19182 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ifrd1P19182 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ifrd1P19182 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ifrd1P19182 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ifrd1P19182 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ifrd1P19182 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ifrd1P19182 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ifrd1P19182 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ifrd1P19182 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ifrd1P19182 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ifrd1P19182 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ifrd1P19182 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ifrd1P19182 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ifrd1P19182 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ifrd1P19182 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ifrd1P19182 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ifrd1P19182 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ifrd1P19182 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ifrd1P19182 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ifrd1P19182 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ifrd1P19182 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ifrd1P19182 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ifrd1P19182 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ifrd1P19182 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ifrd1P19182 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ifrd1P19182 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ifrd1P19182 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ifrd1P19182 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ifrd1P19182 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ifrd1P19182 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ifrd1P19182 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ifrd1P19182 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ifrd1P19182 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Ifrd1P19182 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Ifrd1P19182 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Ifrd1P19182 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ifrd1P19182 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ifrd1P19182 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ifrd1P19182 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ifrd1P19182 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ifrd1P19182 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Ifrd1P19182 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ifrd1P19182 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ifrd1P19182 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ifrd1P19182 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ifrd1P19182 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ifrd1P19182 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ifrd1P19182 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ifrd1P19182 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ifrd1P19182 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ifrd1P19182 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Ifrd1P19182 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ifrd1P19182 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ifrd1P19182 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ifrd1P19182 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ifrd1P19182 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ifrd1P19182 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ifrd1P19182 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ifrd1P19182 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ifrd1P19182 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ifrd1P19182 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ifrd1P19182 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ifrd1P19182 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ifrd1P19182 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Ifrd1P19182 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms