Protein–RNA interactions for Protein: P19123

Tnnc1, Troponin C, slow skeletal and cardiac muscles, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnc1P19123 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnnc1P19123 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnnc1P19123 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnnc1P19123 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnnc1P19123 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnnc1P19123 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnnc1P19123 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnnc1P19123 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnnc1P19123 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnnc1P19123 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnnc1P19123 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnnc1P19123 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnnc1P19123 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnnc1P19123 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnnc1P19123 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnnc1P19123 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnnc1P19123 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnnc1P19123 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnnc1P19123 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnnc1P19123 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnnc1P19123 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnnc1P19123 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnnc1P19123 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnnc1P19123 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnnc1P19123 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnnc1P19123 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnnc1P19123 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnnc1P19123 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnnc1P19123 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnnc1P19123 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnnc1P19123 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnnc1P19123 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnnc1P19123 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnnc1P19123 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnnc1P19123 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnnc1P19123 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnnc1P19123 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnnc1P19123 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnnc1P19123 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnnc1P19123 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnnc1P19123 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnnc1P19123 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnnc1P19123 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnnc1P19123 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnnc1P19123 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnnc1P19123 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnnc1P19123 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnnc1P19123 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnnc1P19123 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnnc1P19123 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnnc1P19123 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnnc1P19123 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnnc1P19123 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnnc1P19123 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnnc1P19123 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnnc1P19123 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnnc1P19123 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnnc1P19123 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnnc1P19123 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnnc1P19123 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnnc1P19123 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnnc1P19123 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnnc1P19123 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnnc1P19123 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnnc1P19123 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnnc1P19123 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnnc1P19123 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnnc1P19123 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnnc1P19123 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnnc1P19123 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnnc1P19123 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnnc1P19123 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnnc1P19123 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnnc1P19123 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnnc1P19123 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnnc1P19123 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnnc1P19123 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnnc1P19123 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnnc1P19123 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnnc1P19123 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnnc1P19123 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnnc1P19123 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnnc1P19123 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnnc1P19123 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnnc1P19123 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnnc1P19123 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnnc1P19123 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnnc1P19123 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnnc1P19123 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnnc1P19123 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnnc1P19123 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnnc1P19123 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnnc1P19123 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnnc1P19123 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnnc1P19123 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnnc1P19123 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnnc1P19123 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnnc1P19123 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnnc1P19123 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnnc1P19123 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.7 ms