Protein–RNA interactions for Protein: P17095

Hmga1, High mobility group protein HMG-I/HMG-Y, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmga1P17095 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Hmga1P17095 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Hmga1P17095 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Hmga1P17095 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Hmga1P17095 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Hmga1P17095 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Hmga1P17095 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hmga1P17095 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hmga1P17095 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hmga1P17095 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hmga1P17095 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hmga1P17095 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Hmga1P17095 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Hmga1P17095 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Hmga1P17095 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Hmga1P17095 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Hmga1P17095 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hmga1P17095 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hmga1P17095 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hmga1P17095 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hmga1P17095 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hmga1P17095 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hmga1P17095 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hmga1P17095 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hmga1P17095 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hmga1P17095 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hmga1P17095 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hmga1P17095 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hmga1P17095 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hmga1P17095 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hmga1P17095 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hmga1P17095 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hmga1P17095 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hmga1P17095 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hmga1P17095 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hmga1P17095 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hmga1P17095 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hmga1P17095 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hmga1P17095 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hmga1P17095 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hmga1P17095 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hmga1P17095 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hmga1P17095 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hmga1P17095 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hmga1P17095 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hmga1P17095 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Hmga1P17095 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Hmga1P17095 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hmga1P17095 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Hmga1P17095 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hmga1P17095 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hmga1P17095 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hmga1P17095 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hmga1P17095 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hmga1P17095 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hmga1P17095 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hmga1P17095 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hmga1P17095 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hmga1P17095 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hmga1P17095 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hmga1P17095 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hmga1P17095 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hmga1P17095 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hmga1P17095 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hmga1P17095 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hmga1P17095 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hmga1P17095 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hmga1P17095 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hmga1P17095 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hmga1P17095 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hmga1P17095 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hmga1P17095 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hmga1P17095 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hmga1P17095 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hmga1P17095 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hmga1P17095 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hmga1P17095 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hmga1P17095 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hmga1P17095 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hmga1P17095 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hmga1P17095 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Hmga1P17095 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hmga1P17095 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hmga1P17095 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hmga1P17095 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hmga1P17095 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hmga1P17095 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hmga1P17095 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Hmga1P17095 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hmga1P17095 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hmga1P17095 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hmga1P17095 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hmga1P17095 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hmga1P17095 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hmga1P17095 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hmga1P17095 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hmga1P17095 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Hmga1P17095 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hmga1P17095 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Hmga1P17095 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms