Protein–RNA interactions for Protein: P15409

Rho, Rhodopsin, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhoP15409 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RhoP15409 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RhoP15409 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RhoP15409 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RhoP15409 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RhoP15409 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RhoP15409 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RhoP15409 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RhoP15409 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RhoP15409 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RhoP15409 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RhoP15409 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RhoP15409 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
RhoP15409 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
RhoP15409 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
RhoP15409 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RhoP15409 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RhoP15409 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RhoP15409 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RhoP15409 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RhoP15409 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RhoP15409 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RhoP15409 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RhoP15409 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RhoP15409 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RhoP15409 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RhoP15409 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RhoP15409 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RhoP15409 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
RhoP15409 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RhoP15409 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RhoP15409 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RhoP15409 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RhoP15409 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RhoP15409 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RhoP15409 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RhoP15409 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RhoP15409 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RhoP15409 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RhoP15409 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RhoP15409 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RhoP15409 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RhoP15409 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RhoP15409 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RhoP15409 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RhoP15409 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RhoP15409 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
RhoP15409 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
RhoP15409 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
RhoP15409 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RhoP15409 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RhoP15409 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RhoP15409 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RhoP15409 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RhoP15409 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RhoP15409 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RhoP15409 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RhoP15409 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RhoP15409 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RhoP15409 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
RhoP15409 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RhoP15409 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RhoP15409 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RhoP15409 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RhoP15409 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RhoP15409 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RhoP15409 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RhoP15409 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RhoP15409 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RhoP15409 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
RhoP15409 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RhoP15409 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RhoP15409 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RhoP15409 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RhoP15409 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RhoP15409 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RhoP15409 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RhoP15409 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RhoP15409 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
RhoP15409 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RhoP15409 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RhoP15409 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RhoP15409 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
RhoP15409 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RhoP15409 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RhoP15409 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RhoP15409 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RhoP15409 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RhoP15409 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RhoP15409 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RhoP15409 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RhoP15409 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RhoP15409 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RhoP15409 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RhoP15409 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RhoP15409 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RhoP15409 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RhoP15409 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RhoP15409 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RhoP15409 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms