Protein–RNA interactions for Protein: P11679

Krt8, Keratin, type II cytoskeletal 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt8P11679 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt8P11679 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt8P11679 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt8P11679 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt8P11679 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt8P11679 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt8P11679 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt8P11679 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt8P11679 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt8P11679 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt8P11679 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt8P11679 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt8P11679 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt8P11679 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt8P11679 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt8P11679 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt8P11679 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt8P11679 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt8P11679 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt8P11679 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt8P11679 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt8P11679 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt8P11679 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt8P11679 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt8P11679 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt8P11679 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt8P11679 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt8P11679 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt8P11679 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt8P11679 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt8P11679 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt8P11679 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt8P11679 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt8P11679 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt8P11679 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt8P11679 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt8P11679 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt8P11679 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt8P11679 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt8P11679 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt8P11679 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt8P11679 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt8P11679 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt8P11679 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt8P11679 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt8P11679 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt8P11679 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt8P11679 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt8P11679 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt8P11679 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt8P11679 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt8P11679 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt8P11679 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt8P11679 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt8P11679 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Krt8P11679 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Krt8P11679 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Krt8P11679 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Krt8P11679 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Krt8P11679 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Krt8P11679 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Krt8P11679 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Krt8P11679 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Krt8P11679 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Krt8P11679 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Krt8P11679 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Krt8P11679 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Krt8P11679 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Krt8P11679 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Krt8P11679 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Krt8P11679 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Krt8P11679 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Krt8P11679 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Krt8P11679 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Krt8P11679 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Krt8P11679 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Krt8P11679 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Krt8P11679 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Krt8P11679 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Krt8P11679 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Krt8P11679 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Krt8P11679 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Krt8P11679 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Krt8P11679 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Krt8P11679 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Krt8P11679 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Krt8P11679 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Krt8P11679 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Krt8P11679 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Krt8P11679 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Krt8P11679 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Krt8P11679 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Krt8P11679 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Krt8P11679 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Krt8P11679 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Krt8P11679 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Krt8P11679 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Krt8P11679 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Krt8P11679 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Krt8P11679 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms