Protein–RNA interactions for Protein: P0DPB4

Schip1, Schwannomin-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Schip1P0DPB4 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Schip1P0DPB4 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Schip1P0DPB4 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Schip1P0DPB4 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Schip1P0DPB4 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Schip1P0DPB4 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Schip1P0DPB4 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Schip1P0DPB4 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Schip1P0DPB4 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Schip1P0DPB4 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Schip1P0DPB4 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Schip1P0DPB4 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Schip1P0DPB4 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Schip1P0DPB4 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Schip1P0DPB4 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Schip1P0DPB4 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Schip1P0DPB4 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Schip1P0DPB4 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Schip1P0DPB4 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Schip1P0DPB4 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Schip1P0DPB4 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Schip1P0DPB4 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Schip1P0DPB4 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Schip1P0DPB4 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Schip1P0DPB4 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Schip1P0DPB4 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Schip1P0DPB4 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Schip1P0DPB4 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Schip1P0DPB4 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Schip1P0DPB4 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Schip1P0DPB4 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Schip1P0DPB4 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Schip1P0DPB4 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Schip1P0DPB4 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Schip1P0DPB4 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Schip1P0DPB4 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Schip1P0DPB4 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Schip1P0DPB4 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Schip1P0DPB4 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Schip1P0DPB4 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Schip1P0DPB4 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Schip1P0DPB4 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Schip1P0DPB4 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Schip1P0DPB4 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Schip1P0DPB4 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Schip1P0DPB4 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Schip1P0DPB4 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Schip1P0DPB4 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Schip1P0DPB4 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Schip1P0DPB4 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Schip1P0DPB4 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Schip1P0DPB4 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Schip1P0DPB4 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Schip1P0DPB4 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Schip1P0DPB4 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Schip1P0DPB4 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Schip1P0DPB4 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Schip1P0DPB4 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Schip1P0DPB4 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Schip1P0DPB4 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Schip1P0DPB4 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Schip1P0DPB4 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Schip1P0DPB4 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Schip1P0DPB4 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Schip1P0DPB4 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Schip1P0DPB4 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Schip1P0DPB4 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Schip1P0DPB4 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Schip1P0DPB4 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Schip1P0DPB4 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Schip1P0DPB4 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Schip1P0DPB4 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Schip1P0DPB4 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Schip1P0DPB4 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Schip1P0DPB4 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Schip1P0DPB4 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Schip1P0DPB4 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Schip1P0DPB4 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Schip1P0DPB4 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Schip1P0DPB4 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Schip1P0DPB4 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Schip1P0DPB4 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Schip1P0DPB4 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Schip1P0DPB4 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Schip1P0DPB4 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Schip1P0DPB4 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Schip1P0DPB4 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Schip1P0DPB4 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Schip1P0DPB4 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Schip1P0DPB4 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Schip1P0DPB4 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Schip1P0DPB4 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Schip1P0DPB4 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Schip1P0DPB4 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Schip1P0DPB4 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Schip1P0DPB4 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Schip1P0DPB4 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Schip1P0DPB4 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Schip1P0DPB4 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Schip1P0DPB4 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms