Protein–RNA interactions for Protein: P05622

Pdgfrb, Platelet-derived growth factor receptor beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,098 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfrbP05622 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PdgfrbP05622 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PdgfrbP05622 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PdgfrbP05622 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PdgfrbP05622 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PdgfrbP05622 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PdgfrbP05622 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PdgfrbP05622 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PdgfrbP05622 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PdgfrbP05622 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PdgfrbP05622 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PdgfrbP05622 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PdgfrbP05622 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PdgfrbP05622 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PdgfrbP05622 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PdgfrbP05622 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PdgfrbP05622 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PdgfrbP05622 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PdgfrbP05622 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PdgfrbP05622 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
PdgfrbP05622 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PdgfrbP05622 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PdgfrbP05622 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
PdgfrbP05622 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
PdgfrbP05622 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PdgfrbP05622 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PdgfrbP05622 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PdgfrbP05622 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PdgfrbP05622 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PdgfrbP05622 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PdgfrbP05622 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PdgfrbP05622 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PdgfrbP05622 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PdgfrbP05622 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PdgfrbP05622 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PdgfrbP05622 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PdgfrbP05622 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PdgfrbP05622 Cisd3-201ENSMUST00000107583 737 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PdgfrbP05622 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PdgfrbP05622 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PdgfrbP05622 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PdgfrbP05622 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PdgfrbP05622 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PdgfrbP05622 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PdgfrbP05622 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PdgfrbP05622 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PdgfrbP05622 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PdgfrbP05622 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PdgfrbP05622 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PdgfrbP05622 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PdgfrbP05622 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PdgfrbP05622 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PdgfrbP05622 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PdgfrbP05622 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PdgfrbP05622 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PdgfrbP05622 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PdgfrbP05622 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PdgfrbP05622 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PdgfrbP05622 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PdgfrbP05622 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PdgfrbP05622 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PdgfrbP05622 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PdgfrbP05622 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PdgfrbP05622 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PdgfrbP05622 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PdgfrbP05622 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PdgfrbP05622 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PdgfrbP05622 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PdgfrbP05622 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PdgfrbP05622 Gm19891-201ENSMUST00000189771 303 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PdgfrbP05622 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PdgfrbP05622 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PdgfrbP05622 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PdgfrbP05622 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PdgfrbP05622 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PdgfrbP05622 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PdgfrbP05622 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PdgfrbP05622 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PdgfrbP05622 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PdgfrbP05622 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PdgfrbP05622 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PdgfrbP05622 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PdgfrbP05622 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PdgfrbP05622 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PdgfrbP05622 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PdgfrbP05622 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PdgfrbP05622 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PdgfrbP05622 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PdgfrbP05622 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PdgfrbP05622 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PdgfrbP05622 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PdgfrbP05622 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PdgfrbP05622 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PdgfrbP05622 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PdgfrbP05622 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PdgfrbP05622 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PdgfrbP05622 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PdgfrbP05622 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PdgfrbP05622 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PdgfrbP05622 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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