Protein–RNA interactions for Protein: P02088

Hbb-b1, Hemoglobin subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hbb-b1P02088 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hbb-b1P02088 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hbb-b1P02088 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hbb-b1P02088 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hbb-b1P02088 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hbb-b1P02088 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hbb-b1P02088 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hbb-b1P02088 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Hbb-b1P02088 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hbb-b1P02088 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hbb-b1P02088 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hbb-b1P02088 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Hbb-b1P02088 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hbb-b1P02088 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hbb-b1P02088 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Hbb-b1P02088 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hbb-b1P02088 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hbb-b1P02088 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hbb-b1P02088 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hbb-b1P02088 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Hbb-b1P02088 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hbb-b1P02088 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hbb-b1P02088 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hbb-b1P02088 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hbb-b1P02088 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hbb-b1P02088 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hbb-b1P02088 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Hbb-b1P02088 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hbb-b1P02088 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hbb-b1P02088 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hbb-b1P02088 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hbb-b1P02088 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hbb-b1P02088 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hbb-b1P02088 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hbb-b1P02088 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hbb-b1P02088 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hbb-b1P02088 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hbb-b1P02088 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hbb-b1P02088 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hbb-b1P02088 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hbb-b1P02088 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hbb-b1P02088 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hbb-b1P02088 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hbb-b1P02088 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hbb-b1P02088 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hbb-b1P02088 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hbb-b1P02088 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hbb-b1P02088 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hbb-b1P02088 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hbb-b1P02088 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hbb-b1P02088 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hbb-b1P02088 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hbb-b1P02088 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hbb-b1P02088 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hbb-b1P02088 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hbb-b1P02088 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hbb-b1P02088 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Hbb-b1P02088 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hbb-b1P02088 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hbb-b1P02088 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hbb-b1P02088 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hbb-b1P02088 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hbb-b1P02088 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hbb-b1P02088 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hbb-b1P02088 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hbb-b1P02088 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Hbb-b1P02088 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hbb-b1P02088 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hbb-b1P02088 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hbb-b1P02088 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hbb-b1P02088 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hbb-b1P02088 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hbb-b1P02088 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hbb-b1P02088 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hbb-b1P02088 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hbb-b1P02088 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hbb-b1P02088 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hbb-b1P02088 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hbb-b1P02088 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hbb-b1P02088 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hbb-b1P02088 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hbb-b1P02088 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hbb-b1P02088 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hbb-b1P02088 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hbb-b1P02088 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hbb-b1P02088 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hbb-b1P02088 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hbb-b1P02088 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hbb-b1P02088 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hbb-b1P02088 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hbb-b1P02088 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hbb-b1P02088 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hbb-b1P02088 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hbb-b1P02088 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hbb-b1P02088 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hbb-b1P02088 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hbb-b1P02088 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Hbb-b1P02088 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hbb-b1P02088 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hbb-b1P02088 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms