Protein–RNA interactions for Protein: P01679

Ig kappa chain V-VI region J539, mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01679 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01679 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01679 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01679 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01679 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01679 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01679 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01679 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01679 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01679 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
P01679 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01679 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01679 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
P01679 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
P01679 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
P01679 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01679 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01679 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01679 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01679 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
P01679 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01679 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01679 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01679 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01679 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01679 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01679 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01679 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01679 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01679 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01679 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01679 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01679 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01679 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01679 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01679 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01679 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01679 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01679 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
P01679 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01679 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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P01679 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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P01679 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01679 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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P01679 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01679 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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P01679 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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P01679 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01679 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01679 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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P01679 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01679 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01679 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01679 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01679 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01679 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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P01679 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01679 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
P01679 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01679 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01679 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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P01679 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01679 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01679 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
P01679 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01679 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01679 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01679 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01679 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01679 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01679 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01679 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01679 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01679 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01679 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01679 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01679 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01679 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01679 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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