Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccl20O89093 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccl20O89093 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccl20O89093 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccl20O89093 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccl20O89093 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccl20O89093 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccl20O89093 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccl20O89093 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccl20O89093 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Ccl20O89093 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Ccl20O89093 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Ccl20O89093 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccl20O89093 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccl20O89093 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccl20O89093 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccl20O89093 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccl20O89093 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccl20O89093 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccl20O89093 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccl20O89093 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccl20O89093 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccl20O89093 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccl20O89093 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccl20O89093 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccl20O89093 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccl20O89093 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccl20O89093 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccl20O89093 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccl20O89093 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccl20O89093 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccl20O89093 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccl20O89093 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccl20O89093 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccl20O89093 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccl20O89093 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccl20O89093 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccl20O89093 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccl20O89093 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccl20O89093 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccl20O89093 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccl20O89093 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccl20O89093 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccl20O89093 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccl20O89093 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccl20O89093 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccl20O89093 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccl20O89093 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccl20O89093 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccl20O89093 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccl20O89093 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccl20O89093 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccl20O89093 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccl20O89093 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccl20O89093 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccl20O89093 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccl20O89093 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccl20O89093 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccl20O89093 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccl20O89093 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccl20O89093 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccl20O89093 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccl20O89093 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccl20O89093 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccl20O89093 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccl20O89093 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccl20O89093 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccl20O89093 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccl20O89093 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccl20O89093 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccl20O89093 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccl20O89093 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccl20O89093 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccl20O89093 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccl20O89093 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccl20O89093 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccl20O89093 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccl20O89093 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccl20O89093 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccl20O89093 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccl20O89093 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccl20O89093 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccl20O89093 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccl20O89093 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccl20O89093 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccl20O89093 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccl20O89093 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccl20O89093 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccl20O89093 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccl20O89093 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccl20O89093 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccl20O89093 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccl20O89093 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccl20O89093 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccl20O89093 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccl20O89093 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccl20O89093 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccl20O89093 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccl20O89093 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccl20O89093 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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