Protein–RNA interactions for Protein: O88978

Lrrc6, Protein tilB homolog, mousemouse

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Length 473 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc6O88978 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrrc6O88978 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrrc6O88978 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrrc6O88978 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrrc6O88978 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrrc6O88978 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrrc6O88978 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrrc6O88978 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrrc6O88978 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrrc6O88978 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrrc6O88978 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrrc6O88978 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrrc6O88978 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrrc6O88978 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrrc6O88978 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrrc6O88978 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrrc6O88978 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrrc6O88978 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrrc6O88978 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrrc6O88978 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrrc6O88978 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrrc6O88978 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Lrrc6O88978 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrrc6O88978 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrrc6O88978 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Lrrc6O88978 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrrc6O88978 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrrc6O88978 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrrc6O88978 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrrc6O88978 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrrc6O88978 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrrc6O88978 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Lrrc6O88978 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrrc6O88978 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrrc6O88978 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrrc6O88978 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Lrrc6O88978 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrrc6O88978 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Lrrc6O88978 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Lrrc6O88978 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Lrrc6O88978 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrrc6O88978 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrrc6O88978 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrrc6O88978 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Lrrc6O88978 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrrc6O88978 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrrc6O88978 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrrc6O88978 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Lrrc6O88978 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
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Lrrc6O88978 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Lrrc6O88978 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrc6O88978 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Lrrc6O88978 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrc6O88978 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrc6O88978 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrc6O88978 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrc6O88978 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrc6O88978 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrc6O88978 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrc6O88978 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrc6O88978 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrc6O88978 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrc6O88978 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrc6O88978 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrc6O88978 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrc6O88978 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrc6O88978 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrc6O88978 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrc6O88978 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrc6O88978 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrc6O88978 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrc6O88978 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms