Protein–RNA interactions for Protein: O88874

Ccnk, Cyclin-K, mousemouse

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Length 554 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcnkO88874 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CcnkO88874 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CcnkO88874 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CcnkO88874 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CcnkO88874 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CcnkO88874 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CcnkO88874 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CcnkO88874 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
CcnkO88874 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CcnkO88874 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CcnkO88874 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CcnkO88874 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CcnkO88874 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CcnkO88874 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
CcnkO88874 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
CcnkO88874 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
CcnkO88874 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
CcnkO88874 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CcnkO88874 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CcnkO88874 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CcnkO88874 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CcnkO88874 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CcnkO88874 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CcnkO88874 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CcnkO88874 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CcnkO88874 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CcnkO88874 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CcnkO88874 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CcnkO88874 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CcnkO88874 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CcnkO88874 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CcnkO88874 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CcnkO88874 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CcnkO88874 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CcnkO88874 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CcnkO88874 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CcnkO88874 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CcnkO88874 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CcnkO88874 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CcnkO88874 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CcnkO88874 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CcnkO88874 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CcnkO88874 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CcnkO88874 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CcnkO88874 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CcnkO88874 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CcnkO88874 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CcnkO88874 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CcnkO88874 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CcnkO88874 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
CcnkO88874 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CcnkO88874 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
CcnkO88874 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CcnkO88874 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
CcnkO88874 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CcnkO88874 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CcnkO88874 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CcnkO88874 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CcnkO88874 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CcnkO88874 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CcnkO88874 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CcnkO88874 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CcnkO88874 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CcnkO88874 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
CcnkO88874 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CcnkO88874 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CcnkO88874 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CcnkO88874 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CcnkO88874 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CcnkO88874 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CcnkO88874 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CcnkO88874 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CcnkO88874 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CcnkO88874 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CcnkO88874 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
CcnkO88874 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
CcnkO88874 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CcnkO88874 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CcnkO88874 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CcnkO88874 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CcnkO88874 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CcnkO88874 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CcnkO88874 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CcnkO88874 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CcnkO88874 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CcnkO88874 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CcnkO88874 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CcnkO88874 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CcnkO88874 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CcnkO88874 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CcnkO88874 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CcnkO88874 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CcnkO88874 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
CcnkO88874 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CcnkO88874 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CcnkO88874 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CcnkO88874 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CcnkO88874 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CcnkO88874 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CcnkO88874 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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