Protein–RNA interactions for Protein: O88834

Shd, SH2 domain-containing adapter protein D, mousemouse

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Length 343 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ShdO88834 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ShdO88834 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ShdO88834 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ShdO88834 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ShdO88834 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ShdO88834 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ShdO88834 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ShdO88834 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ShdO88834 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ShdO88834 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ShdO88834 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ShdO88834 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ShdO88834 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ShdO88834 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ShdO88834 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ShdO88834 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ShdO88834 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ShdO88834 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ShdO88834 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ShdO88834 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ShdO88834 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ShdO88834 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ShdO88834 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ShdO88834 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ShdO88834 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ShdO88834 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ShdO88834 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ShdO88834 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ShdO88834 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ShdO88834 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ShdO88834 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ShdO88834 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ShdO88834 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ShdO88834 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ShdO88834 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ShdO88834 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ShdO88834 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ShdO88834 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ShdO88834 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ShdO88834 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ShdO88834 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ShdO88834 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ShdO88834 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ShdO88834 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ShdO88834 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ShdO88834 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ShdO88834 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ShdO88834 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ShdO88834 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ShdO88834 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ShdO88834 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ShdO88834 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ShdO88834 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ShdO88834 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ShdO88834 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ShdO88834 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ShdO88834 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ShdO88834 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ShdO88834 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ShdO88834 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ShdO88834 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ShdO88834 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ShdO88834 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ShdO88834 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ShdO88834 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ShdO88834 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ShdO88834 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ShdO88834 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ShdO88834 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ShdO88834 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ShdO88834 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ShdO88834 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ShdO88834 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ShdO88834 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ShdO88834 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ShdO88834 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ShdO88834 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ShdO88834 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ShdO88834 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ShdO88834 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ShdO88834 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ShdO88834 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ShdO88834 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ShdO88834 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ShdO88834 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ShdO88834 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ShdO88834 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ShdO88834 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ShdO88834 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ShdO88834 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ShdO88834 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ShdO88834 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ShdO88834 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ShdO88834 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ShdO88834 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ShdO88834 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ShdO88834 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ShdO88834 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ShdO88834 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ShdO88834 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
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