Protein–RNA interactions for Protein: O88508

Dnmt3a, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnmt3aO88508 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dnmt3aO88508 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dnmt3aO88508 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dnmt3aO88508 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dnmt3aO88508 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dnmt3aO88508 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dnmt3aO88508 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Dnmt3aO88508 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dnmt3aO88508 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Dnmt3aO88508 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dnmt3aO88508 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dnmt3aO88508 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dnmt3aO88508 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dnmt3aO88508 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dnmt3aO88508 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dnmt3aO88508 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dnmt3aO88508 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dnmt3aO88508 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dnmt3aO88508 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dnmt3aO88508 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dnmt3aO88508 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dnmt3aO88508 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dnmt3aO88508 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dnmt3aO88508 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dnmt3aO88508 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dnmt3aO88508 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dnmt3aO88508 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dnmt3aO88508 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dnmt3aO88508 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dnmt3aO88508 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dnmt3aO88508 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dnmt3aO88508 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dnmt3aO88508 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dnmt3aO88508 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dnmt3aO88508 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dnmt3aO88508 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dnmt3aO88508 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dnmt3aO88508 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dnmt3aO88508 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dnmt3aO88508 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dnmt3aO88508 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dnmt3aO88508 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dnmt3aO88508 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dnmt3aO88508 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dnmt3aO88508 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dnmt3aO88508 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dnmt3aO88508 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dnmt3aO88508 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dnmt3aO88508 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dnmt3aO88508 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dnmt3aO88508 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dnmt3aO88508 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dnmt3aO88508 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Dnmt3aO88508 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Dnmt3aO88508 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dnmt3aO88508 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dnmt3aO88508 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dnmt3aO88508 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dnmt3aO88508 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dnmt3aO88508 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dnmt3aO88508 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dnmt3aO88508 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dnmt3aO88508 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dnmt3aO88508 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dnmt3aO88508 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dnmt3aO88508 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dnmt3aO88508 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dnmt3aO88508 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dnmt3aO88508 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dnmt3aO88508 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dnmt3aO88508 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dnmt3aO88508 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dnmt3aO88508 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dnmt3aO88508 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dnmt3aO88508 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dnmt3aO88508 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dnmt3aO88508 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dnmt3aO88508 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dnmt3aO88508 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dnmt3aO88508 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dnmt3aO88508 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dnmt3aO88508 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dnmt3aO88508 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dnmt3aO88508 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Dnmt3aO88508 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dnmt3aO88508 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dnmt3aO88508 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dnmt3aO88508 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dnmt3aO88508 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dnmt3aO88508 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dnmt3aO88508 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dnmt3aO88508 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dnmt3aO88508 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dnmt3aO88508 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dnmt3aO88508 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dnmt3aO88508 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dnmt3aO88508 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dnmt3aO88508 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dnmt3aO88508 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dnmt3aO88508 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms