Protein–RNA interactions for Protein: O70439

Stx7, Syntaxin-7, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx7O70439 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Stx7O70439 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Stx7O70439 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Stx7O70439 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Stx7O70439 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Stx7O70439 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Stx7O70439 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Stx7O70439 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Stx7O70439 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Stx7O70439 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Stx7O70439 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Stx7O70439 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Stx7O70439 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Stx7O70439 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Stx7O70439 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Stx7O70439 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Stx7O70439 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Stx7O70439 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Stx7O70439 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Stx7O70439 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Stx7O70439 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Stx7O70439 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Stx7O70439 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Stx7O70439 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Stx7O70439 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Stx7O70439 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Stx7O70439 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Stx7O70439 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Stx7O70439 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Stx7O70439 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Stx7O70439 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Stx7O70439 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Stx7O70439 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Stx7O70439 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Stx7O70439 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Stx7O70439 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Stx7O70439 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Stx7O70439 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Stx7O70439 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stx7O70439 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stx7O70439 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stx7O70439 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stx7O70439 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stx7O70439 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stx7O70439 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stx7O70439 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stx7O70439 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stx7O70439 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stx7O70439 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stx7O70439 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stx7O70439 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stx7O70439 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stx7O70439 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stx7O70439 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stx7O70439 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Stx7O70439 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Stx7O70439 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stx7O70439 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Stx7O70439 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Stx7O70439 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stx7O70439 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stx7O70439 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stx7O70439 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stx7O70439 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stx7O70439 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stx7O70439 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stx7O70439 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stx7O70439 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stx7O70439 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stx7O70439 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stx7O70439 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stx7O70439 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stx7O70439 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Stx7O70439 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stx7O70439 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stx7O70439 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stx7O70439 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stx7O70439 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stx7O70439 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stx7O70439 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stx7O70439 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stx7O70439 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Stx7O70439 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stx7O70439 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stx7O70439 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stx7O70439 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stx7O70439 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stx7O70439 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stx7O70439 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stx7O70439 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stx7O70439 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stx7O70439 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stx7O70439 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stx7O70439 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stx7O70439 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stx7O70439 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stx7O70439 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stx7O70439 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stx7O70439 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stx7O70439 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms