Protein–RNA interactions for Protein: O70401

Tspan6, Tetraspanin-6, mousemouse

Predictions only

Length 245 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan6O70401 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tspan6O70401 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tspan6O70401 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tspan6O70401 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Tspan6O70401 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tspan6O70401 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tspan6O70401 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tspan6O70401 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tspan6O70401 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tspan6O70401 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tspan6O70401 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tspan6O70401 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tspan6O70401 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tspan6O70401 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tspan6O70401 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Tspan6O70401 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tspan6O70401 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tspan6O70401 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Tspan6O70401 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tspan6O70401 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tspan6O70401 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tspan6O70401 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tspan6O70401 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tspan6O70401 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Tspan6O70401 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tspan6O70401 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tspan6O70401 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tspan6O70401 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tspan6O70401 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Tspan6O70401 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tspan6O70401 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tspan6O70401 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Tspan6O70401 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Tspan6O70401 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tspan6O70401 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tspan6O70401 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tspan6O70401 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tspan6O70401 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tspan6O70401 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tspan6O70401 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tspan6O70401 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tspan6O70401 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tspan6O70401 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tspan6O70401 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tspan6O70401 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tspan6O70401 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Tspan6O70401 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tspan6O70401 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tspan6O70401 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tspan6O70401 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tspan6O70401 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tspan6O70401 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tspan6O70401 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tspan6O70401 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tspan6O70401 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Tspan6O70401 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tspan6O70401 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tspan6O70401 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tspan6O70401 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tspan6O70401 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tspan6O70401 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tspan6O70401 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tspan6O70401 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tspan6O70401 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tspan6O70401 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tspan6O70401 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tspan6O70401 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tspan6O70401 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tspan6O70401 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tspan6O70401 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tspan6O70401 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tspan6O70401 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tspan6O70401 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tspan6O70401 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tspan6O70401 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tspan6O70401 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tspan6O70401 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tspan6O70401 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tspan6O70401 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tspan6O70401 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tspan6O70401 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tspan6O70401 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tspan6O70401 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tspan6O70401 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Tspan6O70401 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tspan6O70401 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tspan6O70401 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tspan6O70401 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tspan6O70401 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tspan6O70401 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tspan6O70401 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tspan6O70401 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tspan6O70401 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tspan6O70401 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tspan6O70401 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tspan6O70401 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tspan6O70401 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tspan6O70401 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tspan6O70401 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tspan6O70401 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms