Protein–RNA interactions for Protein: O70157

Top3a, DNA topoisomerase 3-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,003 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Top3aO70157 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Top3aO70157 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Top3aO70157 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Top3aO70157 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
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Top3aO70157 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Top3aO70157 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Top3aO70157 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Top3aO70157 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Top3aO70157 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Top3aO70157 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Top3aO70157 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Top3aO70157 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Top3aO70157 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Top3aO70157 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Top3aO70157 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Top3aO70157 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Top3aO70157 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Top3aO70157 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Top3aO70157 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Top3aO70157 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Top3aO70157 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Top3aO70157 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Top3aO70157 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Top3aO70157 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Top3aO70157 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Top3aO70157 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Top3aO70157 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Top3aO70157 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Top3aO70157 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Top3aO70157 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Top3aO70157 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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