Protein–RNA interactions for Protein: O55187

Cbx4, E3 SUMO-protein ligase CBX4, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx4O55187 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cbx4O55187 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cbx4O55187 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cbx4O55187 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cbx4O55187 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cbx4O55187 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cbx4O55187 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cbx4O55187 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cbx4O55187 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cbx4O55187 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cbx4O55187 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cbx4O55187 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cbx4O55187 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cbx4O55187 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cbx4O55187 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cbx4O55187 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cbx4O55187 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cbx4O55187 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cbx4O55187 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cbx4O55187 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cbx4O55187 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cbx4O55187 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cbx4O55187 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Cbx4O55187 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cbx4O55187 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cbx4O55187 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cbx4O55187 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cbx4O55187 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cbx4O55187 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cbx4O55187 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cbx4O55187 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cbx4O55187 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cbx4O55187 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cbx4O55187 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cbx4O55187 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cbx4O55187 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cbx4O55187 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cbx4O55187 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cbx4O55187 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cbx4O55187 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cbx4O55187 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cbx4O55187 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cbx4O55187 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cbx4O55187 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cbx4O55187 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cbx4O55187 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cbx4O55187 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cbx4O55187 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cbx4O55187 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cbx4O55187 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cbx4O55187 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cbx4O55187 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cbx4O55187 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cbx4O55187 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cbx4O55187 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cbx4O55187 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cbx4O55187 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cbx4O55187 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cbx4O55187 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cbx4O55187 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cbx4O55187 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cbx4O55187 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cbx4O55187 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cbx4O55187 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cbx4O55187 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Cbx4O55187 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cbx4O55187 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cbx4O55187 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cbx4O55187 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cbx4O55187 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Cbx4O55187 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cbx4O55187 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cbx4O55187 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cbx4O55187 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cbx4O55187 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cbx4O55187 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cbx4O55187 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cbx4O55187 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cbx4O55187 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cbx4O55187 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cbx4O55187 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cbx4O55187 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cbx4O55187 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cbx4O55187 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cbx4O55187 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cbx4O55187 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cbx4O55187 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cbx4O55187 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cbx4O55187 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cbx4O55187 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cbx4O55187 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cbx4O55187 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cbx4O55187 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Cbx4O55187 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cbx4O55187 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Cbx4O55187 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cbx4O55187 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Cbx4O55187 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cbx4O55187 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Cbx4O55187 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms