Protein–RNA interactions for Protein: O55111

Dsg2, Desmoglein-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Dsg2O55111 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Dsg2O55111 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Dsg2O55111 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Dsg2O55111 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Dsg2O55111 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Dsg2O55111 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Dsg2O55111 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Dsg2O55111 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Dsg2O55111 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Dsg2O55111 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Dsg2O55111 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Dsg2O55111 Tmem150cos-201ENSMUST00000143245 1216 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Dsg2O55111 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Dsg2O55111 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Dsg2O55111 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Dsg2O55111 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Dsg2O55111 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Dsg2O55111 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Dsg2O55111 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Dsg2O55111 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Dsg2O55111 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Dsg2O55111 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Dsg2O55111 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
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