Protein–RNA interactions for Protein: O55103

Prx, Periaxin, mousemouse

Predictions only

Length 1,391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrxO55103 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PrxO55103 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PrxO55103 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PrxO55103 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PrxO55103 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PrxO55103 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PrxO55103 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PrxO55103 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PrxO55103 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PrxO55103 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PrxO55103 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PrxO55103 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PrxO55103 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PrxO55103 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PrxO55103 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PrxO55103 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PrxO55103 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PrxO55103 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PrxO55103 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PrxO55103 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PrxO55103 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
PrxO55103 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
PrxO55103 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
PrxO55103 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
PrxO55103 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
PrxO55103 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PrxO55103 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PrxO55103 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PrxO55103 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PrxO55103 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PrxO55103 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PrxO55103 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PrxO55103 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PrxO55103 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PrxO55103 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PrxO55103 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PrxO55103 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PrxO55103 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PrxO55103 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PrxO55103 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PrxO55103 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PrxO55103 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PrxO55103 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PrxO55103 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PrxO55103 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PrxO55103 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PrxO55103 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PrxO55103 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PrxO55103 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PrxO55103 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PrxO55103 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PrxO55103 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PrxO55103 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PrxO55103 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PrxO55103 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PrxO55103 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PrxO55103 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PrxO55103 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PrxO55103 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PrxO55103 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PrxO55103 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PrxO55103 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PrxO55103 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PrxO55103 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PrxO55103 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PrxO55103 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PrxO55103 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PrxO55103 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PrxO55103 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PrxO55103 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PrxO55103 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PrxO55103 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PrxO55103 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PrxO55103 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PrxO55103 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PrxO55103 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PrxO55103 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PrxO55103 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PrxO55103 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PrxO55103 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PrxO55103 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PrxO55103 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PrxO55103 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PrxO55103 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PrxO55103 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PrxO55103 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PrxO55103 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PrxO55103 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PrxO55103 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PrxO55103 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PrxO55103 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PrxO55103 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PrxO55103 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PrxO55103 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PrxO55103 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PrxO55103 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PrxO55103 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PrxO55103 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PrxO55103 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PrxO55103 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms