Protein–RNA interactions for Protein: O55029

Copb2, Coatomer subunit beta', mousemouse

Predictions only

Length 905 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copb2O55029 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Copb2O55029 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Copb2O55029 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Copb2O55029 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Copb2O55029 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Copb2O55029 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Copb2O55029 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Copb2O55029 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Copb2O55029 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Copb2O55029 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Copb2O55029 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Copb2O55029 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Copb2O55029 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Copb2O55029 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Copb2O55029 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Copb2O55029 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Copb2O55029 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Copb2O55029 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Copb2O55029 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Copb2O55029 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Copb2O55029 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Copb2O55029 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Copb2O55029 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Copb2O55029 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Copb2O55029 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Copb2O55029 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Copb2O55029 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Copb2O55029 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Copb2O55029 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Copb2O55029 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Copb2O55029 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Copb2O55029 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Copb2O55029 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Copb2O55029 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Copb2O55029 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Copb2O55029 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Copb2O55029 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Copb2O55029 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Copb2O55029 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Copb2O55029 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Copb2O55029 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Copb2O55029 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Copb2O55029 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Copb2O55029 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Copb2O55029 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Copb2O55029 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Copb2O55029 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Copb2O55029 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Copb2O55029 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Copb2O55029 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Copb2O55029 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Copb2O55029 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Copb2O55029 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Copb2O55029 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Copb2O55029 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Copb2O55029 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Copb2O55029 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Copb2O55029 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Copb2O55029 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Copb2O55029 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Copb2O55029 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Copb2O55029 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Copb2O55029 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Copb2O55029 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Copb2O55029 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Copb2O55029 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Copb2O55029 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Copb2O55029 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Copb2O55029 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Copb2O55029 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Copb2O55029 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Copb2O55029 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Copb2O55029 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Copb2O55029 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Copb2O55029 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Copb2O55029 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Copb2O55029 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Copb2O55029 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Copb2O55029 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Copb2O55029 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Copb2O55029 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Copb2O55029 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Copb2O55029 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Copb2O55029 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Copb2O55029 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Copb2O55029 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Copb2O55029 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Copb2O55029 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Copb2O55029 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Copb2O55029 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Copb2O55029 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Copb2O55029 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Copb2O55029 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Copb2O55029 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Copb2O55029 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Copb2O55029 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Copb2O55029 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Copb2O55029 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Copb2O55029 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Copb2O55029 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms