Protein–RNA interactions for Protein: O54751

Crx, Cone-rod homeobox protein, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrxO54751 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
CrxO54751 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
CrxO54751 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
CrxO54751 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
CrxO54751 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
CrxO54751 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
CrxO54751 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
CrxO54751 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
CrxO54751 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
CrxO54751 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
CrxO54751 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
CrxO54751 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
CrxO54751 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
CrxO54751 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC11□□□□□ -0.65
CrxO54751 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
CrxO54751 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
CrxO54751 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
CrxO54751 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC11□□□□□ -0.65
CrxO54751 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
CrxO54751 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
CrxO54751 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
CrxO54751 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
CrxO54751 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
CrxO54751 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
CrxO54751 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC11□□□□□ -0.65
CrxO54751 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
CrxO54751 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
CrxO54751 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
CrxO54751 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
CrxO54751 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
CrxO54751 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
CrxO54751 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
CrxO54751 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
CrxO54751 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
CrxO54751 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
CrxO54751 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
CrxO54751 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
CrxO54751 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
CrxO54751 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
CrxO54751 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
CrxO54751 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
CrxO54751 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
CrxO54751 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
CrxO54751 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
CrxO54751 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC11□□□□□ -0.65
CrxO54751 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
CrxO54751 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
CrxO54751 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
CrxO54751 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
CrxO54751 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
CrxO54751 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CrxO54751 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
CrxO54751 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CrxO54751 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CrxO54751 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CrxO54751 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CrxO54751 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CrxO54751 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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CrxO54751 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
CrxO54751 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CrxO54751 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CrxO54751 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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CrxO54751 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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CrxO54751 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CrxO54751 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CrxO54751 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CrxO54751 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CrxO54751 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CrxO54751 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CrxO54751 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
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CrxO54751 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CrxO54751 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CrxO54751 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CrxO54751 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CrxO54751 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
CrxO54751 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CrxO54751 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CrxO54751 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CrxO54751 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CrxO54751 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CrxO54751 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CrxO54751 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CrxO54751 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CrxO54751 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CrxO54751 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CrxO54751 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CrxO54751 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CrxO54751 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CrxO54751 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
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