Protein–RNA interactions for Protein: O35984

Pbx2, Pre-B-cell leukemia transcription factor 2, mousemouse

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Length 430 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pbx2O35984 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pbx2O35984 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pbx2O35984 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pbx2O35984 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Pbx2O35984 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pbx2O35984 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pbx2O35984 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pbx2O35984 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pbx2O35984 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pbx2O35984 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pbx2O35984 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Pbx2O35984 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pbx2O35984 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Pbx2O35984 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pbx2O35984 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pbx2O35984 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pbx2O35984 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pbx2O35984 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pbx2O35984 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pbx2O35984 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pbx2O35984 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pbx2O35984 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pbx2O35984 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pbx2O35984 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pbx2O35984 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pbx2O35984 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pbx2O35984 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pbx2O35984 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pbx2O35984 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pbx2O35984 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pbx2O35984 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pbx2O35984 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pbx2O35984 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pbx2O35984 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pbx2O35984 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pbx2O35984 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pbx2O35984 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pbx2O35984 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pbx2O35984 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pbx2O35984 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pbx2O35984 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pbx2O35984 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pbx2O35984 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pbx2O35984 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pbx2O35984 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pbx2O35984 Gm13780-201ENSMUST00000150482 1187 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pbx2O35984 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pbx2O35984 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pbx2O35984 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pbx2O35984 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pbx2O35984 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pbx2O35984 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pbx2O35984 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pbx2O35984 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pbx2O35984 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pbx2O35984 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pbx2O35984 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pbx2O35984 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pbx2O35984 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pbx2O35984 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pbx2O35984 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pbx2O35984 AC154849.3-201ENSMUST00000223733 1660 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Pbx2O35984 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pbx2O35984 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pbx2O35984 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pbx2O35984 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pbx2O35984 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pbx2O35984 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pbx2O35984 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pbx2O35984 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pbx2O35984 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pbx2O35984 2810403D21Rik-206ENSMUST00000151166 1107 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pbx2O35984 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pbx2O35984 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pbx2O35984 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pbx2O35984 Gm43553-201ENSMUST00000200900 685 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Pbx2O35984 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pbx2O35984 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pbx2O35984 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pbx2O35984 Gm10702-201ENSMUST00000098929 1268 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Pbx2O35984 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pbx2O35984 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pbx2O35984 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pbx2O35984 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pbx2O35984 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pbx2O35984 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pbx2O35984 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pbx2O35984 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pbx2O35984 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pbx2O35984 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pbx2O35984 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pbx2O35984 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pbx2O35984 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pbx2O35984 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pbx2O35984 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pbx2O35984 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pbx2O35984 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pbx2O35984 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pbx2O35984 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pbx2O35984 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms